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南京農大免疫所與揚州大學(xué)獸醫學(xué)院等多家單位合作在Cell 子刊發(fā)文系統闡述我國H7N9流感病毒流行和進(jìn)化特點(diǎn)

2018-07-18 來(lái)源:中國病毒學(xué)論壇  標簽: 掌上醫生 喝茶減肥 一天瘦一斤 安全減肥 cps聯(lián)盟 美容護膚
摘要:自2013年3月中國發(fā)現了首例人感染H7N9禽流感病毒病例以來(lái),每年冬春季都會(huì )出現一波人感染的疫情,截止到2017年5月23日止已有五波共1486人感染H7N9流感病毒,死亡率約為38%。

 近日,南京農業(yè)大學(xué)免疫研究所以第一完成單位聯(lián)合揚州大學(xué)和中國科學(xué)院微生物研究所等單位,在病毒學(xué)領(lǐng)域國際頂級期刊《TrendsinMicrobiology》上發(fā)表論文“Epidemiology,EvolutionandPathogenesisofH7N9influenzavirusesinfiveepidemicwavessince2013inChina”細胞出版社出版的《TrendsinMicrobiology》創(chuàng )刊于1993年,年發(fā)文量100篇左右,該期刊2016年影響因子為11.02,近5年平均影響因子為10.239。免疫研究所粟碩教授為論文第一作者,揚州大學(xué)獸醫學(xué)院顧敏副教授為論文共同第一作者,中國科學(xué)院微生物研究所的劉翟研究員和高福院士以及中國科學(xué)院武漢病毒所的崔杰研究員等為論文的主要作者。揚州大學(xué)獸醫學(xué)院劉秀梵院士和免疫研究所周繼勇教授為論文通訊作者。

 
自2013年3月中國發(fā)現了首例人感染H7N9禽流感病毒病例以來(lái),每年冬春季都會(huì )出現一波人感染的疫情,截止到2017年5月23日止已有五波共1486人感染H7N9流感病毒,死亡率約為38%。2016年10月開(kāi)始的第五波H7N9流感病毒感染人的疫情中,不僅感染人數增加,而且在地理位置上出現了向我國西部省份擴散的現象。從第五波疫情開(kāi)始,部分H7N9病毒出現了變異變成了高致病性毒株,出現了高致病性H7N9流感病毒感染人的病例,同時(shí)在湖南、河北等省的部分家禽養殖場(chǎng)也開(kāi)始爆發(fā)新發(fā)的高致病性H7N9禽流感病毒疫情,超過(guò)30萬(wàn)羽雞被撲殺。H7N9流感病毒不僅對人類(lèi)健康造成巨大威脅,也嚴重威脅我國的養殖業(yè)。因此,新出現的高致病性H7N9禽流感疫情受到全社會(huì )的高度關(guān)注。
 
基于這些背景,由揚州大學(xué)獸醫學(xué)院劉秀梵院士團隊與南京農業(yè)大學(xué)免疫研究所周繼勇教授團隊牽頭,多個(gè)單位的研究人員對2013年以來(lái)的五波H7N9流感病毒疫情從病例臨床特征、分布范圍、病毒的進(jìn)化趨勢和生物學(xué)特征等方面進(jìn)行了系統流行病學(xué)研究和分析。疫情特征表現為,珠三角與長(cháng)三角地區病例數顯著(zhù)高于其他地區,男性病人顯著(zhù)高于女性病例。針對H7N9流感病毒目前在我國的流行特點(diǎn)和基因組序列進(jìn)化特征,研究人員首次通過(guò)遺傳進(jìn)化大數據分析發(fā)現,2015-2016年流行的第四波H7N9流感疫情,病毒全部由之前的三波病毒進(jìn)化而來(lái),一部分來(lái)源于長(cháng)三角和珠三角地區共同流行的cladeWave3-2分支;另一部分則由全部來(lái)源于珠三角的cladeWave3-1分支進(jìn)化而來(lái),并且全部分布于珠三角區域。2016年底出現的第五波H7N9流感疫情,主要由第四波在長(cháng)三角和珠三角地區共同流行的cladeWave3-2分支進(jìn)化而來(lái),其中最新出現的高致病性H7N9毒株均來(lái)自于珠三角區域并形成一個(gè)獨立的分支,提示高致病性H7N9流感病毒起源于珠三角地區。通過(guò)氨基酸位點(diǎn)分析,發(fā)現新出現的H7N9流感病毒HA蛋白獲得了高致病性禽流感病毒裂解位點(diǎn)的特征,NA蛋白出現了R292K、E119V、R152K,I222K/R的突變,揭示了潛在的多重耐藥特征,提示未來(lái)需加強臨床上的耐藥監測,以便及時(shí)調整治療方案。
 
高致病性H7N9禽流感病毒的出現,不僅威脅人類(lèi)健康,也給我國的養禽業(yè)帶來(lái)巨大的經(jīng)濟損失,應持續加強對該病毒的監測。本研究首次通過(guò)對五波H7N9疫情中分離的H7N9病毒進(jìn)行系統遺傳進(jìn)化分析揭示H7N9病毒在我國的遺傳演化特征和流行特征,為防控新發(fā)的高致病性H7N9流感病毒感染人和高致病性H7N9在禽中的爆發(fā)提供重要指導和理論依據。
 
(A)截止到2017年4月,H7N9流感病毒感染人的五波疫情中感染病例數與死亡數統計。(B)用RAxML方法系統展示了H7N9流感病毒HA基因的進(jìn)化樹(shù),以病毒shanghai/1/2013H7N9為根。高致病性H7N9流感病毒用深紫色表示。使用藍色,黃色與沒(méi)有顏色來(lái)區分病毒的分離于長(cháng)三角地區,珠三角地區還是其他地區。紅色表示人感染的H7N9病毒分離株,無(wú)色表示環(huán)境或者禽類(lèi)的H7N9病毒分離株。
 
(A)用RAxML方法系統展示了H7N9流感病毒NA基因的進(jìn)化樹(shù)。(B)利用3D結構模型展示H7N9流感病毒NA蛋白上的耐藥基因位點(diǎn)變化。
 
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