12月14日，國際學(xué)術(shù)權威刊物自然出版集團旗下子刊《NatureBiotechnology》雜志上在線(xiàn)發(fā)表斯坦福大學(xué)MichaelSnyder研究員發(fā)表的一篇研究論文，研究人員首次將一種新測序技術(shù)用于人類(lèi)腸道微生物組，揭示了驚人的細菌多樣性。
MichaelSnyder教授說(shuō)“這些細菌在遺傳學(xué)上比我們想象的更加多樣化”。人類(lèi)個(gè)體之間只有千分之一的基因組序列有差異，而同種細菌的不同個(gè)體居然有四分之一的序列存在差異。這樣的復雜性非常驚人，我們此前完全沒(méi)有想到。
過(guò)去研究者們只能研究實(shí)驗室培養的細菌，但大多數細菌其實(shí)無(wú)法在傳統培養基上生長(cháng)。結果人們一直沒(méi)能充分認識人類(lèi)腸道甚至整個(gè)世界的細菌多樣性。誕生于上世紀90年代的宏基因組學(xué)為人們打開(kāi)了一扇新的大門(mén)，揭示了像熱帶雨林一樣多樣性豐富的細菌世界。宏基因組學(xué)不經(jīng)過(guò)培養階段，直接提取環(huán)境中總DNA進(jìn)行研究和分析。隨著(zhù)高通量測序技術(shù)不斷更新?lián)Q代，宏基因組學(xué)得到了快速的發(fā)展。然而由于技術(shù)限制，宏基因組測序給出的信息還比較模糊。
人類(lèi)消化道中居住著(zhù)大量的微生物，它們被統稱(chēng)為腸道微生物組。腸道微生物組在人類(lèi)代謝食物、抵御感染和應答藥物等過(guò)程中起到了重要的作用。近年來(lái)科學(xué)家們發(fā)現，人類(lèi)腸道中的共生菌對人體健康有很大的影響。一些腸道菌有益于人體健康，一些腸道菌與肥胖癥、二型糖尿病、腸道病和肝病有關(guān)，還有一些腸道菌可以致病甚至致命(比如特定大腸桿菌和霍亂弧菌)。正因如此，腸道微生物組成為了新的研究熱點(diǎn)。
研究人員將Illumina長(cháng)讀取技術(shù)與計算工具結合起來(lái)，克服了短讀取測序的技術(shù)限制，獲得了一名男性腸道微生物組的清晰圖譜。
目前大多數基因組測序讀出的是短DNA序列。如果只是測序一個(gè)基因組(一個(gè)細菌或是一個(gè)人)，我們可以像玩拼圖那樣把這些片段組裝成起來(lái)，并沒(méi)有多么困難。但如果我們是在測序和組裝人類(lèi)腸道的微生物組，就相當于把100個(gè)拼圖打散混合再?lài)L試將它們拼起來(lái)，想一想都令人頭大。更具挑戰性的是，這些拼圖看起來(lái)差異不大，而且沒(méi)有一個(gè)可以參考的圖片。
“我們通常是通過(guò)短讀取測序獲得一小段一小段的信息，”Snyder說(shuō)。Snyder及其同事使用新生物信息學(xué)方法，將較大的基因組片段裝訂在一起。“我們用復雜的算法先將小片段組裝成10,000-base片段，再將10,000-base片段組裝成更長(cháng)的片段，然后拼出整個(gè)基因組。”這種橫跨數百甚至數千個(gè)基因的長(cháng)DNA，是很難從短讀取測序中復原出來(lái)的。這些序列可以幫助人們對細菌進(jìn)行分類(lèi)，發(fā)現容易被忽略的稀有細菌。
驚人的細菌多樣性
這么長(cháng)的基因組片段不僅能鑒定不同的細菌種屬，還可以區分同種細菌的不同菌株。研究人員用已知細菌組成的標準樣本測試了自己的方法，并將這種方法用于一名男性的腸道菌樣本。研究顯示，腸道微生物組包括許多種細菌，同種細菌又包含不同類(lèi)型的菌株。舉例來(lái)說(shuō)，有一種細菌在該男性體內有五個(gè)不同的菌株。
目前還很難預計這種多樣性對人體健康的影響，不過(guò)可以肯定的是不同菌株具有不同的致病性。許多E.coli菌株在人類(lèi)腸道中是無(wú)害甚至有益的，但有些菌株卻可能致命。這項研究使用的測序技術(shù)可以幫助研究者們明確哪些菌株有危險，以及這些菌株產(chǎn)生危險的原因。
過(guò)去的細菌毒力研究需要分離菌株并進(jìn)行培養，但有些細菌是很難培養的。在人類(lèi)腸道樣本中通過(guò)宏基因組測序直接分析毒力基因，不需要進(jìn)行菌株分離和培養。“這有助于更好的認識致病基因，對于理解發(fā)病機理非常有效”。
研究指出，將Illumina長(cháng)讀取技術(shù)與短讀取測序相結合，能夠更加精確和全面的分析宏基因組樣本，更容易在人、動(dòng)物、植物、水和土壤中建立致病菌菌株的進(jìn)化史。長(cháng)讀取提供的信息讓我們可以更加清晰的統觀(guān)全局。
阻止人體腋窩大汗腺的分泌，抑制微生物的分解，從而抑制狐臭的形成。
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健客價(jià)： ￥25磺胺類(lèi)藥屬廣譜抗菌藥，但由于目前許多臨床常見(jiàn)病原菌對該類(lèi)藥物耐藥故僅用于敏感細菌及其他敏感病原微生物所致的感染?；前粪奏?不包括該類(lèi)藥與甲氧芐啶的復方制劑)的適應癥為：1.敏感腦膜炎球菌所致的流行性腦脊髓膜炎的治療和預防。2.與甲氧芐啶合用可治療對其敏感的流感嗜血桿菌、肺炎鏈球菌和其他鏈球菌所致的中耳炎及皮膚軟組織等感染。3.星形奴卡菌病。4.對氯喹耐藥的惡性瘧疾治療的輔助用藥。5.為治療沙眼衣原
健客價(jià)： ￥161.十二指腸潰瘍2.胃潰瘍3.中重度反流性食管炎4.與下述藥物配伍用能夠根除幽門(mén)螺桿菌感染(1) 克拉霉素和阿莫西林(2) 克拉霉素和甲硝唑（詳見(jiàn)用藥方法）以減少該微生物感染所致的十二指腸潰瘍與胃潰瘍的復發(fā)。提示泮托拉唑不用于治療病變輕微的胃腸道疾患如神經(jīng)性消化不良。在應用泮托拉唑治療胃潰瘍前須除外胃與食道的惡性病變以免因癥狀緩解而延誤診斷。反流性食管炎的診斷應經(jīng)內鏡檢查核實(shí)。
健客價(jià)： ￥88本品可用于治療如下條件中指明的微生物的敏感菌株引起的感染：? 1.下呼吸系統感染：由β-內酰胺酶產(chǎn)生菌嗜血桿菌或摩拉克菌引起。? 2.中耳炎：由β-內酰胺酶產(chǎn)生菌嗜血桿菌或摩拉克菌引起。? 3.竇炎：由β-內酰胺酶產(chǎn)生菌嗜血桿菌或摩拉克菌引起。? 4.皮膚及皮膚軟組織感染：由β-內酰胺酶產(chǎn)生菌葡萄球菌、大腸桿菌或克雷白桿菌引起。? 5.尿路感染：由大腸桿菌，克雷白桿菌或腸桿菌引起。?
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