本周出版的英國《自然》雜志上發(fā)表的一項傳染病學(xué)研究論文，描述了一個(gè)可以被裝入行李箱并運輸到現場(chǎng)使用的埃博拉病毒基因組測序監測系統，這個(gè)系統在收集樣本后24小時(shí)內就可以得出結果。該論文還介紹了在西非幾內亞最近的埃博拉疫情中成功使用這個(gè)系統進(jìn)行實(shí)時(shí)監測疫情的案例。
在監控疫情方面，病毒基因組測序獲取的信息有助于了解病毒在大規模傳播過(guò)程中出現了何種變異，這對判斷疫情發(fā)展趨勢非常重要。但由于病毒傳播速度快，如何更快、更高效地完成相關(guān)分析流程就成為關(guān)鍵。
英國伯明翰大學(xué)的尼古拉斯·羅曼和他的研究團隊此次開(kāi)發(fā)的基因組監測系統，使用的是一個(gè)重量小于100克的DNA測序裝置，可以用標準的航空行李運送，也可以插入筆記本電腦的USB接口。研究團隊使用該系統測序分析了142個(gè)從2015年3月份到10月份收集的埃博拉病毒樣本。研究人員發(fā)現，他們可以在24小時(shí)內得到分析結果，測序過(guò)程只需要不到一小時(shí)。
在去年埃博拉肆虐期間，該系統曾被率先部署在西非國家幾內亞的一個(gè)疫區。研究人員在埃博拉患者身上收集到樣本后，在現場(chǎng)利用這個(gè)系統進(jìn)行病毒基因組測序，無(wú)需再把這些樣本長(cháng)途運回實(shí)驗室。
研究團隊認為，這一系統顯示出在資源缺乏的情況下進(jìn)行實(shí)時(shí)基因組監控是可行的，并且該設施可以被迅速建立起來(lái)以便監測疫情。
報告作者之一、伯明翰大學(xué)學(xué)者尼克·洛曼說(shuō)，基因組測序反映的信息在疫情暴發(fā)期間對研究人員來(lái)說(shuō)非常重要，以往這項繁瑣工作只能在配備大型設備的實(shí)驗室里才能完成，而便攜式測序裝置有望改變這種狀況。
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