日前,以“融合創(chuàng )新方案,芯領(lǐng)精準醫療”為主題的第三屆英特爾生命科學(xué)信息技術(shù)論壇舉行。來(lái)自政府、醫學(xué)界、產(chǎn)業(yè)界、學(xué)術(shù)界等的代表齊聚一堂,分析數據驅動(dòng)下的精準醫療現狀與挑戰,分享全球趨勢和新興機會(huì ),共同探討本土創(chuàng )新與實(shí)踐。同時(shí),本屆論壇公布了一系列精準醫療領(lǐng)域的重要成果,進(jìn)一步加速了精準醫療的普及化進(jìn)程。
數據驅動(dòng)精準醫療創(chuàng )新與變革“數據是精準醫療行業(yè)發(fā)展的‘原力’,準確、海量的數據是精準醫療的重要實(shí)現條件,如何有效地匯集、存儲、管理和分析數據是目前精準醫療面臨的關(guān)鍵挑戰。”科技部重大科學(xué)計劃轉錄組研究首席科學(xué)家、中國科學(xué)院北京基因組研究所研究員于軍表示,以數據分析、云計算為主導的IT技術(shù)正與生物技術(shù)有機融合,從而實(shí)現對海量數據的提取和分析等,推動(dòng)精準醫療的創(chuàng )新和落地。
“精準醫療是數據驅動(dòng)的科學(xué),是生命科學(xué)、醫學(xué)技術(shù)和計算技術(shù)融合的前沿領(lǐng)域。”英特爾公司全球副總裁兼中國區總裁楊旭表示,“對海量數據和各種形態(tài)數據的處理和分析是精準醫療的重點(diǎn)。英特爾作為一家數據公司,不斷拓展計算的邊界,提供大數據、云計算、人工智能以及網(wǎng)絡(luò )存儲等尖端技術(shù),促進(jìn)精準醫療的快速發(fā)展。”
創(chuàng )新成果推動(dòng)精準醫療普及化
目前,中國精準醫療已經(jīng)成為國家層面推動(dòng)和市場(chǎng)力量主導的戰略性新興產(chǎn)業(yè)。與會(huì )代表表示,中國正立于精準醫療的潮頭,具備得天獨厚的發(fā)展土壤。在數據的推動(dòng)下,企業(yè)、醫生、醫院、基金組織和政府部門(mén)正在推進(jìn)緊密合作。從本屆論壇上發(fā)布的一系列創(chuàng )新成果上可一窺端倪。
論壇上,博德研究所、英特爾、華大基因、阿里云和浪潮聯(lián)合宣布推出BIGstack解決方案和GATK中國社區。美國博德研究所GATK團隊代表KateVoss表示,博德研究所開(kāi)放了GATK4的源代碼,并與英特爾攜手利用英特爾CPU、Omni-PathFabric和SSD開(kāi)發(fā)了博德—英特爾基因組學(xué)堆棧(BIGstack)的突破性架構。此外,華大基因將采用最新的GATK工具,并與阿里云合作,使客戶(hù)能夠在華大基因在線(xiàn)平臺上訪(fǎng)問(wèn)GATK4、博德的工作流管理系統Cromwell以及WDL(工作流定義語(yǔ)言)。浪潮人工智能與高性能事業(yè)部總經(jīng)理劉軍表示,BIGstack這個(gè)交鑰匙解決方案將作為參考設計,通過(guò)原始設備制造商(OEM)和系統集成商來(lái)提供,浪潮是中國首家提供這個(gè)交鑰匙解決方案的OEM合作伙伴。據悉,GATK中國社區將為生態(tài)系統合作伙伴提供技術(shù)支持,合作伙伴致力于基于GATK4、Cromwell和WDL的研究和應用。
此外,英特爾與上海市兒童醫院宣布啟動(dòng)兒童健康協(xié)作云中心。該云中心是一個(gè)開(kāi)放式平臺,是雙方針對兒童遺傳基因組研究和數據交換應用于臨床的范例。在合作伙伴的共同努力下,這一最佳數據交換框架已在上海市兒童醫院、聯(lián)盟醫院和上海交大生物醫學(xué)轉化中心上線(xiàn)。同時(shí),諾禾致源與英特爾共同成立基于RSD的可擴展基因組學(xué)中心,通過(guò)提高大規模數據處理能力以滿(mǎn)足全球化、可擴展基因組數據中心模式的需求。
華大基因副總裁王洪琦表示,華大基因推出采用英特爾FPGA的基因組一體機?;贔PGA的基因一體機加速了基因分析流程,提供更高的計算性能和更低的能耗,滿(mǎn)足中國基因組學(xué)研發(fā)對基因組數據處理的最新要求。
值得一提的是基因組一體機聯(lián)合實(shí)驗室的成立。該實(shí)驗室是英特爾精準醫療伙伴計劃的下屬聯(lián)盟,浪潮、UEC、華大基因、聚道科技、阿里云、Falcon和安諾優(yōu)達與英特爾合作打造的,為醫院和研究機構客戶(hù)開(kāi)發(fā)基因組學(xué)設備,以便處理本地數據分析需求,并提供更好的用戶(hù)體驗和出色的性能。
對此,英特爾醫療與生命科學(xué)集團亞太區總經(jīng)理李亞?wèn)|表示:“實(shí)現”2020年一天內完成基因數據的收集、分析和解讀“的愿景,推動(dòng)精準醫療走好每一步,中國要在普及化上越走越快。”