在最近一項研究中,科學(xué)家們首次通過(guò)模擬哺乳動(dòng)物單個(gè)細胞基因組的物理結構,給我們展示了關(guān)于DNA在細胞中包裝的獨特視角。
通過(guò)這項新的技術(shù),科學(xué)家們能夠理解細胞中染色體的組合方式,以及決定細胞活化或者不活化的分子基礎。
目前該技術(shù)僅僅在小鼠的細胞上進(jìn)行了試驗,不過(guò)它能夠清楚地幫助我們理解動(dòng)物生長(cháng)發(fā)育的機制以及細胞的功能紊亂是如何導致疾病的發(fā)生的。
“通過(guò)對基因以及控制元件的時(shí)空坐標進(jìn)行全面地了解,能夠幫助我們理解基因表達的調控以及維持其活性的分子機制”,研究者們之一,來(lái)自英國劍橋大學(xué)的ErnestLaue說(shuō)道。
基因組可以被認為是我們身體的藍圖,但藍圖的不同部分被使用的時(shí)機也大不相同。
人類(lèi)細胞中儲存的DNA長(cháng)達兩米,而其能夠被包裹于直徑僅為0.005微米的細胞核中。因此,DNA的包裹機制應該十分地精確。
在這項研究中,科學(xué)家們觀(guān)察了小鼠的胚胎干細胞中的DNA的折疊組裝的情況。通過(guò)一種叫做HI-C的方法,即通過(guò)對DNA進(jìn)行定位從而計算得到基因組結構,科學(xué)家們得到了八個(gè)細胞基因組的高清圖像。
雖然研究者們僅僅捕捉到了整個(gè)基因組中DNA連接的1.2%-4.1%,但由于高清圖像的存在,他們能夠獲取基因組的3D結構,從而對每個(gè)基因是否處于活化狀態(tài)進(jìn)行判斷。
“對基因組進(jìn)行如此高分辨率的3D展示是此前從未出現過(guò)的”,英國分子生物學(xué)家TomCollins說(shuō)道。他認為在未來(lái)的研究中應當囊括基因組之間相互作用的機制,以及DNA的結構對其表達活性的影響。“如果我們將這一技術(shù)應用到基因簇存在缺陷的細胞,例如癌細胞中,那么我們有可能找到疾病發(fā)生的根本原因以及治療方法”。
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