研究采用兩種二代測序（NGS）技術(shù)：全外顯子測序（WES）用于檢測腫瘤和胚系突變，轉錄組測序（RAN-seq）用于分析腫瘤的RNA表達。突變檢測包括點(diǎn)突變、插入/缺失、異位、拷貝數變化、基因表達異常等。收集患者的臨床病例參數，并將其與基因信息關(guān)聯(lián)。

　　轉移灶腫瘤組織標本來(lái)自88例對一種或一種以上激素治療耐藥的轉移性乳腺癌患者，其中有27例患者有治療前的初始標本和治療后（他莫昔芬、芳香化酶抑制劑、氟維司群）的耐藥標本。

　　WES測序結果顯示，在未治療的雌激素受體陽(yáng)性乳腺癌標本中，ESR1、ERBB2和RB1基因突變的發(fā)生率有較大差異，ESR1突變占19.3%（n=17），CCND1擴增占59.1%（n=52），MAP2K4雙等位基因失活占15.9%（n=14）。

　　與初始腫瘤標本相比，來(lái)自同一個(gè)患者的獲得性耐藥后腫瘤標本有一些新的基因突變出現，包括ESR1、ERBB2、PIK3CA、PTEN、RB1、AKT1等。其中有一些如TP53、GATA3、PIK3CA、AKT1和KRAS與原發(fā)腫瘤關(guān)系更為密切。

　　對轉移性標本轉錄組測序數據的初步分析可以將個(gè)體化耐藥機制進(jìn)行分類(lèi)，并納入到更大的耐藥模型中。研究者指出，部分基因突變可能涉及到乳腺癌治療抵抗：ESR1與芳香化酶抑制劑，ERBB2與雌激素受體靶向藥，RB1與內分泌治療和CDK4/6抑制劑，相關(guān)領(lǐng)域的研究正在進(jìn)行中。

　　深入分子層面

　　上述研究結果顯示出轉移灶腫瘤組織分子檢測的重要性。腫瘤組織生長(cháng)是動(dòng)態(tài)進(jìn)化的，轉移灶雖然是從原發(fā)灶而來(lái)，但內部已經(jīng)發(fā)生了變化。針對復發(fā)轉移疾病的治療要考慮到這些復雜因素，并在臨床試驗和新藥探索上朝這方面努力。

　　基因測序給出的突變結果很多，但評價(jià)這些突變的重要性是一項挑戰。在檢測對象上，除了全基因組外，轉錄組分析也能提供有價(jià)值的信息。對乳腺癌耐藥來(lái)說(shuō)，腫瘤進(jìn)化出耐藥可通過(guò)DNA突變以外的途徑，比如表觀(guān)遺傳學(xué)，這就需要在轉錄層面進(jìn)行檢測。

　　結語(yǔ)

　　原發(fā)腫瘤的分子特點(diǎn)部分決定了轉移的潛能；而轉移腫瘤又因外部治療和內部環(huán)境的變化，出現了獨有的分子特點(diǎn)。對于晚期乳腺癌而言，控制、監測轉移病變和逆轉耐藥是延長(cháng)生存的主要方向。

　　2016SABCS上公布這項乳腺癌基因檢測研究是更為龐大計劃“耐藥圖譜”的一部分，現在Dana-Farber精準醫療癌癥中心已經(jīng)收集了超過(guò)250個(gè)標本，同時(shí)還每2個(gè)月采集一次患者的血液樣本，未來(lái)晚期乳腺癌的時(shí)空變化有望得到更好的闡釋。