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柳葉刀子刊:首個(gè)用于診斷癌癥起源的表觀(guān)遺傳學(xué)檢測問(wèn)世

2016-08-30 來(lái)源:健客網(wǎng)社區  標簽: 掌上醫生 喝茶減肥 一天瘦一斤 安全減肥 cps聯(lián)盟 美容護膚
摘要:研究人員建立了基于微陣列DNA甲基化標簽(microarrayDNAmethylationsignatures)的癌癥分類(lèi)方法,并將之稱(chēng)為EPICUP。

  8月26日,巴塞羅那大學(xué)遺傳學(xué)教授ManelEsteller在《TheLancetOncology》雜志中展示了一種新發(fā)明的表觀(guān)遺傳學(xué)檢測技術(shù)——EPICUP,這種技術(shù)可以診斷腫瘤的起源,使醫生能夠根據腫瘤類(lèi)型來(lái)制定更具體的治療方案。

  對于癌癥患者,初級診斷往往包括檢測原發(fā)腫瘤以及是否會(huì )發(fā)生轉移。然而,5%-10%的人類(lèi)腫瘤的診斷結果與之相反,即往往先診斷出轉移的腫瘤,使用各種診斷測試后仍無(wú)法檢測到原發(fā)灶,這種情況也被稱(chēng)為未知原發(fā)灶腫瘤(CUP)。由于腫瘤類(lèi)型不為人所知,這些患者的生存率非常有限。

  ManelEsteller教授是ICREA研究員、Bellvitge生物醫學(xué)研究所(IDIBELL)表觀(guān)遺傳學(xué)與癌癥生物工程(PEBC)主管,他說(shuō),“幾年前,我們開(kāi)始認識到,調節基因活性的化學(xué)模式(表觀(guān)遺傳學(xué))因組織而異,例如它們在胰腺細胞和肺細胞中各有不同。我們已經(jīng)通過(guò)一萬(wàn)多個(gè)人類(lèi)腫瘤樣本分析了每種癌癥的表觀(guān)遺傳學(xué)特征。如今在研究原發(fā)灶未知的轉移腫瘤的DNA時(shí),我們可以通過(guò)所獲取的表觀(guān)基因圖像來(lái)判斷它屬于哪個(gè)家族,如屬于胰腺癌、結直腸癌、肺癌或者是乳腺癌等,換句話(huà)說(shuō),通過(guò)這種方法我們可以診斷腫瘤的起源。”

  通過(guò)表觀(guān)遺傳學(xué)檢測來(lái)確定癌癥的類(lèi)型,將對治療有顯著(zhù)的影響。“從現在開(kāi)始,患者將不用接受盲目的治療,因為我們能夠為不同類(lèi)型的腫瘤提供更具體的治療方案;事實(shí)上,我們的初步數據顯示,這種方法使患者生存率翻了一番。”Esteller教授說(shuō),“需要記住的是,這不是未開(kāi)發(fā)的領(lǐng)域,如今我們已經(jīng)與Ferrer實(shí)驗室合作使這種方法的推廣和應用成為了可能。”

  那么,EPICUP到底是個(gè)怎樣的技術(shù)?

  研究人員建立了基于微陣列DNA甲基化標簽(microarrayDNAmethylationsignatures)的癌癥分類(lèi)方法,并將之稱(chēng)為EPICUP。數據源于2790個(gè)起源已知的腫瘤樣本,這些樣本代表了38類(lèi)腫瘤,包括85個(gè)轉移病例。

  為了驗證這種癌癥分類(lèi)方法,研究人員使用了另外一組包含7691個(gè)腫瘤的樣本,這些腫瘤的來(lái)源與上述樣本相同,包含了534個(gè)轉移病例。研究人員利用自己開(kāi)發(fā)的診斷方法來(lái)預測216個(gè)起源未知但特征明顯的腫瘤的類(lèi)型,并在尸體解剖檢查、光鏡、綜合免疫組化分析之后對原發(fā)部位進(jìn)行數月臨床檢測,從而對EPICUP方法預測腫瘤類(lèi)型的準確度進(jìn)行驗證。

  結果發(fā)現,在包含7691個(gè)腫瘤樣本的試驗組中,基于DNA甲基化的腫瘤分類(lèi)方法表現出的特異性、敏感性、陽(yáng)性預測值和陰性預測值分別為99.6%、97.7%、88.6%和99.9%。對于216個(gè)起源未知的腫瘤,DNA甲基化分析能夠預測出了87%的起源。與接受經(jīng)驗性治療方法的患者相比,EPICUP診斷后接受特異性治療的患者總生存率有改善。

  研究人員解釋?zhuān)l(fā)展基于DNA甲基化的診斷方法可顯著(zhù)提高未知原發(fā)灶腫瘤的診斷效率,并能更精確地指導治療。表觀(guān)遺傳學(xué)分析可揭露未知原發(fā)灶患者的原發(fā)性腫瘤部位,對癌癥患者的臨床管理有進(jìn)一步改善。

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