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Cancer Discovery:細胞對CRISPR的應答不容忽視

2016-06-09 來(lái)源:健客網(wǎng)社區  標簽: 掌上醫生 喝茶減肥 一天瘦一斤 安全減肥 cps聯(lián)盟 美容護膚
摘要:細菌一直在與病毒或入侵核酸進(jìn)行斗爭,為此它們演化出了多種防御機制,CRISPR-Cas適應性免疫系統就是其中之一。規律成簇的間隔短回文重復CRISPR與內切酶Cas9的組合,可以在引導RNA的指引下,靶標并切割入侵者的遺傳物質(zhì)。

  這兩年幾乎人人都在談?wù)揅RISPR基因組編輯,那么細胞對這個(gè)系統的闖入作何感想呢?最近發(fā)表的一項研究指出,細胞會(huì )對CRISPR-Cas9產(chǎn)生一種不容忽視的應答。

  細菌一直在與病毒或入侵核酸進(jìn)行斗爭,為此它們演化出了多種防御機制,CRISPR-Cas適應性免疫系統就是其中之一。規律成簇的間隔短回文重復CRISPR與內切酶Cas9的組合,可以在引導RNA的指引下,靶標并切割入侵者的遺傳物質(zhì)。這種特性使CRISPR系統成為了基因組編輯和基因功能研究的實(shí)用工具。

  CRISPR-Cas9能夠很方便的在哺乳動(dòng)物細胞中進(jìn)行體細胞遺傳篩選。但哈佛大學(xué)Dana-Farber癌癥研究所的科學(xué)家們在實(shí)踐中發(fā)現,CRISPR-Cas9靶標會(huì )使細胞產(chǎn)生一種不依賴(lài)基因的應答。而這種應答會(huì )干擾人們對CRISPR篩選數據的解讀。

  為了鑒定增殖的必需基因,研究人員用CRISPR-Cas9在33個(gè)癌細胞系中進(jìn)行了全基因組的功能缺失篩選。他們發(fā)現,基因組編輯之后的基因拷貝數增加和細胞活力下降有很強的關(guān)聯(lián)。

  在拷貝數增加的區域中,CRISPR-Cas9靶標會(huì )誘導G2細胞周期停滯,由此顯著(zhù)減少癌細胞的增殖。這項研究表明,被CRISPR-Cas9靶標的基因組引起了不依賴(lài)基因的抗增殖細胞應答。理解這種影響對于正確解讀CRISPR-Cas9篩選數據非常重要。

  基因篩選是經(jīng)典的生物學(xué)研究方法,常用于鑒定在生物學(xué)過(guò)程中起作用的基因。十多年來(lái)RNAi一直是這一領(lǐng)域的王者,然而新興技術(shù)的涌現(尤其是CRISPR技術(shù))正在逐漸瓦解RNAi的統治地位。那么,在RNAi和CRISPR篩選之間我們究竟應該如何抉擇呢?

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