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全外顯子組測序合作研究為白質(zhì)病患兒帶來(lái)新希望

2016-05-14 來(lái)源:健客網(wǎng)社區  標簽: 掌上醫生 喝茶減肥 一天瘦一斤 安全減肥 cps聯(lián)盟 美容護膚
摘要:白質(zhì)異常(whitematterabnormalities)是與年齡相關(guān)的進(jìn)展性疾病,它發(fā)生在連接大腦各個(gè)部分之間的神經(jīng)部位以及與脊髓連接的神經(jīng)部位。每年,每7,000名出生的兒童中就有1名患上這種疾病。這項研究匯集了28名署名的合作者,由國家兒童健康系統領(lǐng)導,包括Illumina和昆士蘭大學(xué)的研究人員。

  Illumina公司、美國國家兒童健康系統和昆士蘭大學(xué)(UQ)近日宣布,一項利用全外顯子組測序(WES)的研究成功地對42%的大腦白質(zhì)異?;颊邔?shí)現了臨床診斷,這種疾病通常難于確診,平均耗時(shí)長(cháng)達八年才能得到診斷。全外顯子組測序是一種能一次查看基因組中的所有基因的技術(shù)。

  白質(zhì)異常(whitematterabnormalities)是與年齡相關(guān)的進(jìn)展性疾病,它發(fā)生在連接大腦各個(gè)部分之間的神經(jīng)部位以及與脊髓連接的神經(jīng)部位。每年,每7,000名出生的兒童中就有1名患上這種疾病。這項研究匯集了28名署名的合作者,由國家兒童健康系統領(lǐng)導,包括Illumina和昆士蘭大學(xué)的研究人員。

  這項研究的成果,題為“Wholeexomesequencinginpatientswithwhitematterabnormalities”的文章發(fā)表在《AnnalsofNeurology》在線(xiàn)版上,全文可訪(fǎng)問(wèn)。這篇文章也將發(fā)表在6月的印刷版上(Volume79,Issue6)。

  “‘罕見(jiàn)’遺傳病這個(gè)詞似乎用得不太恰當,因為全球可能有多達3.5億人經(jīng)受這類(lèi)疾病的影響,”這項研究的主要作者,國家兒童健康系統髓鞘疾病項目的主任AdelineVanderver這么解釋。“我們的研究發(fā)現,新一代測序也許能為那些影響大腦白質(zhì)的極具挑戰性的遺傳病診斷點(diǎn)亮一盞明燈。”

  “我們對這種方法的威力感到高興,”文章的共同作者,Illumina的科學(xué)研究總監RyanJ.Taft博士說(shuō)。“在這項研究中,利用基于新一代測序的WES大大提高了診斷率,并縮短了診斷時(shí)間。”

  “白質(zhì)病可能對患者及其家庭造成毀滅性的影響,”昆士蘭大學(xué)罕見(jiàn)病研究中心分子生物科學(xué)研究所的CasSimons博士介紹說(shuō),他也是共同作者之一。“及時(shí)準確地獲得診斷結果,對告知許多醫療決定和改善患者的生活質(zhì)量是至關(guān)重要的。”

  超過(guò)100種遺傳病與中樞神經(jīng)系統中的白質(zhì)異常存在關(guān)聯(lián)。至少10種不同的化學(xué)物質(zhì)組成了髓磷脂(一種脂質(zhì)的絕緣層),而髓鞘在電脈沖沿著(zhù)神經(jīng)細胞平穩傳播中發(fā)揮了關(guān)鍵作用。一組被稱(chēng)為腦白質(zhì)營(yíng)養不良的罕見(jiàn)遺傳病與髓磷脂如何形成或利用基本化學(xué)物質(zhì)上的遺傳缺陷有關(guān),導致大腦白質(zhì)出現進(jìn)行性退化。

  據Taft博士介紹,診斷白質(zhì)病的標準方法在幾乎50%的患兒中不起作用,這使得他們的護理復雜化,并為家庭帶來(lái)了巨大的心理負擔。人類(lèi)基因組大約包含30億個(gè)DNA堿基?;蚪M中的蛋白編碼區域,即外顯子組,僅代表2%的遺傳密碼,但含有大多數與疾病相關(guān)的變異。

  在過(guò)去20年,人們多采用MRI(核磁共振成像)來(lái)識別腦白質(zhì)營(yíng)養不良的真實(shí)模式,但近一半的患者缺乏具體的診斷。由于WES能夠對其他疑難雜癥進(jìn)行診斷,研究小組提出,這種技術(shù)也許能破解被認為是腦白質(zhì)營(yíng)養不良的遺傳懸案。

  這個(gè)研究小組利用Illumina的技術(shù)對191個(gè)被認為是自然遺傳的、未確診的腦白質(zhì)病病例家庭進(jìn)行分析。在這一組中,研究人員利用MRI模式識別以及標準的生化和遺傳檢測對101個(gè)家庭進(jìn)行診斷。對于剩余90個(gè)未診斷的病例,71個(gè)家庭中至少有3名成員參與研究,并提供了WES分析所需的高質(zhì)量樣本。盡管測序時(shí)患者的年齡在3-26歲,但一些人的癥狀是從出生就開(kāi)始的。

  根據這項研究,在臨床醫生的診斷工具中添加WES“有望將未確診的白質(zhì)病患者的數量從50%降低到30%??紤]到這些家庭在漫長(cháng)的診斷之旅中的臨床和社會(huì )心理成本,這是相當可觀(guān)的。”診斷為某些患者的臨床護理帶來(lái)更高的精度,而帶有某些突變的家庭將被轉診到專(zhuān)科診所,進(jìn)行癌癥的監控?;谶@些成果,研究小組正研究在神經(jīng)發(fā)育障礙患兒的多地前瞻性研究中使用全基因組測序,這將可能進(jìn)一步提高診斷率。

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