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Science突破性進(jìn)展:RNA剪輯在疾病中起重要作用

2016-05-03 來(lái)源:健客網(wǎng)社區  標簽: 掌上醫生 喝茶減肥 一天瘦一斤 安全減肥 cps聯(lián)盟 美容護膚
摘要:在過(guò)去的十年中,全基因組關(guān)聯(lián)研究在揭示人類(lèi)基因組的差異與生物性狀和復雜疾病之間的關(guān)系取得了顯著(zhù)成果。眾多單個(gè)堿基的突變叫做數量性狀位點(diǎn),大多數是在基因以外的區域,被認為在基因表達調控中發(fā)揮作用。不過(guò)絕大多數數量性狀位點(diǎn)的功能尚不清楚。

  發(fā)表在4月29日Science上的研究報告中,來(lái)自芝加哥大學(xué)和斯坦福大學(xué)的研究人員研究了數千影響在身高、多發(fā)性硬化癥等疾病過(guò)程中基因調節的突變。研究結果強調了對在復雜性狀和疾病差異中RNA剪輯所起的作用需要更好的了解,這也許能夠讓人們對全基因組相關(guān)的研究進(jìn)行更準確的功能性理解。該研究發(fā)現突變和疾病差異之間的關(guān)聯(lián)是可以由RNA剪輯變化來(lái)解釋。

  在過(guò)去的十年中,全基因組關(guān)聯(lián)研究在揭示人類(lèi)基因組的差異與生物性狀和復雜疾病之間的關(guān)系取得了顯著(zhù)成果。眾多單個(gè)堿基的突變叫做數量性狀位點(diǎn),大多數是在基因以外的區域,被認為在基因表達調控中發(fā)揮作用。不過(guò)絕大多數數量性狀位點(diǎn)的功能尚不清楚。

  為了全面了解遺傳變異的潛在作用,斯坦福大學(xué)的研究人員對收集自70個(gè)個(gè)體的全基因組和細胞系數據應用了一套強大的統計工具。在持續了8年的一系列試驗中,他們分析了和7個(gè)調節表型相關(guān)的數量性狀位點(diǎn),包括基因表達水平、RNA轉錄和蛋白翻譯。對于每個(gè)調節表型,研究團隊鑒定了數量性狀位點(diǎn)并對它們在基因調控每一步的作用進(jìn)行量化。他們發(fā)現很多數量性狀位點(diǎn)在它們影響轉錄、翻譯和蛋白水平的效果上是重疊的。

  之前從未分析過(guò)群體樣本的這么多數據集。研究人員還開(kāi)發(fā)了一種新的計算方法,稱(chēng)為L(cháng)eafCutter。這是第一次能有效鑒定包含在RNA剪輯中的數量性狀位點(diǎn)。

  研究結果揭示了幾乎3千個(gè)剪輯特異性的數量性狀位點(diǎn),很多在遺傳性狀生物學(xué)和疾病中起重要的作用。RNA剪輯中的數量性狀位點(diǎn)在多發(fā)性硬化癥中富集,在其它性狀中大致相等。很多剪輯中的數量性狀位點(diǎn)并不影響基因的表達水平,這提示了RNA剪輯是獨立的,但在復雜性狀和疾病中也同等重要。

  這個(gè)研究為RNA剪輯在遺傳變異和疾病間的重要聯(lián)系提供了第一個(gè)全面的數據證明。重要的是,通過(guò)全基因組關(guān)聯(lián)分析鑒定的基因差異顯著(zhù)能夠分析是否在RNA剪輯中起作用。

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