2015年1月20日，美國總統奧巴馬在國情咨文中提出“精準醫學(xué)計劃”，希望精準醫學(xué)可以引領(lǐng)一個(gè)醫學(xué)新時(shí)代。在奧巴馬宣布啟動(dòng)精準醫學(xué)計劃的一年后，中國當前正在確定它自己的更大型的項目計劃。2015年12月9日至12日，由中國藥理學(xué)會(huì )藥物基因組學(xué)專(zhuān)業(yè)委員會(huì )主辦、上海交通大學(xué)Bio-X研究院與康昱盛承辦的國際精準醫學(xué)與未來(lái)健康前沿研討會(huì )暨全國第三屆藥物基因組學(xué)學(xué)術(shù)大會(huì )，在上海隆重召開(kāi)。中國政府有望在今年3月批準它的下一個(gè)五年計劃之后正式宣布該計劃。盡管目前尚不清楚將會(huì )投入多少資金——但幾乎可以確定的是，會(huì )比美國2.15億美元的計劃規模更大，投入資金更多。

　　新一代測序技術(shù)（NGS）在精準醫療中的地位不可或缺，可謂是精準醫療的“先行者”。最近，在《GenomeMedicine》雜志上發(fā)表的一項研究報告顯示，大多數在醫學(xué)上具有重要意義的基因，都位于人類(lèi)基因組中比較復雜、難以分析的區域，目前難以獲得準確的序列信息。通常，這些醫學(xué)上重要的基因中有五分之一，用今天的基因測序方法來(lái)進(jìn)行破譯，是具有挑戰性的，這些基因區域中的信息，可能對于患者的診斷或治療計劃至關(guān)重要。

　　為了優(yōu)化醫療護理，預測疾病風(fēng)險并選擇適當的藥物，就需要我們準確解釋每位患者的遺傳密碼。因此，斯坦福大學(xué)研究人員在這項研究中，強調了測序誤差會(huì )帶來(lái)的醫學(xué)影響。

　　這些誤差包括假陽(yáng)性（識別并不在那里的基因突變）和假陰性（未能檢測到合理的致病突變）。兩者都可能對病人的治療產(chǎn)生深遠的影響。例如，在BRCA2基因（這個(gè)著(zhù)名的基因與遺傳性乳腺癌和卵巢癌相關(guān)）中的假陽(yáng)性突變，可能導致手術(shù)風(fēng)險的降低，如雙側乳腺切除術(shù)和卵巢切除術(shù)。因此，一個(gè)錯誤識別的突變可能導致激進(jìn)的和不必要的手術(shù)。

　　斯坦福大學(xué)研究團隊使用美國國家標準與技術(shù)研究所（NIST）提供的一份金標準的基因組序列。這個(gè)基因，屬于一名歐洲血統的女性，此前通過(guò)五種不同的測序技術(shù)而被測序。NIST研究團隊結合來(lái)自所有五種技術(shù)的結果，在技術(shù)允許的基因組區域中，開(kāi)發(fā)一種可靠的共有序列。他們在這名捐贈者77%的基因組中獲得了一種可靠的共有序列。

　　通過(guò)研究捐贈者基因組中這些“高可信度”的區域，如何與已知引發(fā)人類(lèi)疾病的3300個(gè)基因重疊，研究人員發(fā)現，對于這些基因當中的593個(gè)基因來(lái)說(shuō)，不到一半的關(guān)鍵蛋白編碼區，位于可能被可靠測序的區域。

　　有一組疾病基因（56個(gè)，包括BRCA2），被美國醫學(xué)遺傳學(xué)和基因組學(xué)學(xué)院（ACMG）視為醫學(xué)上最“可行的”?，F在，ACMG指南需要臨床基因檢測實(shí)驗室，來(lái)篩選所有接受外顯子組或基因組測序的患者，以在這56個(gè)基因中尋找致病突變，這些基因與一些可治療的疾病相關(guān)，從遺傳性癌癥危到及生命的心律失常。例如，患者最初可能進(jìn)行了測序以確定他們的自閉癥原因，但也被告知在BRCA2中有一個(gè)偶然發(fā)現，目的都是預測或預防疾病。

　　斯坦福大學(xué)的研究人員發(fā)現，對這些醫學(xué)上的重要基因來(lái)說(shuō)，每個(gè)基因的蛋白質(zhì)編碼區通常只有80%能夠被可靠地測序。

　　這項研究還表明，目前確定的大多數致病突變，位于易于測序的區域。具體來(lái)說(shuō)，致病突變被分類(lèi)到ClinVar數據庫中，超過(guò)80%的位于NIST基因組的高置信區域內。此外，這些ClinVar突變絕大多數（超過(guò)98%）位于獨特DNA序列的延伸部位，我們知道這里很容易測序。

　　這些結果強調，需要某種測序的方法，更好地滲透到很難測序的基因組區域，從而準確地揭示目前有可能被掩蓋的致病突變。

　　本文第一作者、來(lái)自斯坦福大學(xué)的RachelGoldfeder說(shuō)：“隨著(zhù)這項技術(shù)從實(shí)驗室轉向臨床，我們需要能夠準確、可靠地測定整個(gè)基因組的序列，因為錯誤的信息會(huì )導致不適當的醫療保健。好消息是，在這種情況下，使用當前的方法，我們能夠可靠地測定77%的供體基因組被?，F在的挑戰是，把我們的努力集中在其他23%的基因組，即基因組中難以捉摸的區域。只有這樣我們才能實(shí)現精確醫學(xué)的全部潛力。”