在《癌癥、生物及治療》雜志上,該大學(xué)佩雷爾曼醫學(xué)院耳鼻咽喉系教授、副主任,該研究的領(lǐng)導者ErleRobertson博士和他的同事們應用所謂病理切片(Pathochip)的檢測方法對復發(fā)性急性髓性白血?。ˋML)患者的組織樣本進(jìn)行檢測。
該患者是一名因為癌癥接受化療的中年男性,眾所周知,化療會(huì )削弱了免疫系統功能,增加了感染的易感性。結果,該患者發(fā)生了一種未知的真菌感染。
這種情況并非罕見(jiàn);根據疾病預防控制中心(CDC)報告,每年在美國大約有60,000名癌癥患者因白細胞計數過(guò)低而住院,其中每14名患者當中就有1名患者死亡。
不言而喻,快速識別感染原因是快速有效地治療這些患者的關(guān)鍵所在。但是還存在一個(gè)主要的問(wèn)題,那就是目前,醫生對某些病原體缺乏有效識別技術(shù)。
其中一種病原菌是一種被稱(chēng)為根毛霉的罕見(jiàn)真菌,這是人類(lèi)難治性真菌感染接合菌病的一個(gè)病因。這種真菌種類(lèi)得花很長(cháng)時(shí)間在實(shí)驗室培養,有些根本就不能培養,這使得對患者的診斷極具挑戰性。
然而,在他們的研究中,Robertson和他的同事們揭示了他們是如何應用病理切片(Pathochip)確定他們研究對象所患“未知”真菌感染的病因——根毛霉的種類(lèi)。
病理切片(Pathochip)在將近24小時(shí)內檢測出真菌感染的病因
研究人員介紹,病理切片(Pathochip)作為一種基因芯片技術(shù)能夠檢測出可能存在成千上萬(wàn)種病原體的人體組織樣本。
該技術(shù)包含60,000個(gè)探頭,可以同時(shí)檢測所有已知病毒,以及各種細菌、真菌、寄生蟲(chóng)和原生動(dòng)物。
“我們研究進(jìn)行了很多測試來(lái)看看我們能否在實(shí)驗室里識別病原體,只是為了看看病理切片(Pathochip)識別多種有機體的功效,我們能夠識別所有接受測試的傳染性病原體,”Robertson說(shuō)。“但是,這是第一次,我們實(shí)實(shí)在在的在一名患者的樣本里確定一種致病菌。”
利用病理切片(Pathochip)測試來(lái)自復發(fā)性急性髓性白血?。ˋML)患者的保存組織樣本,研究人員能夠在短短24個(gè)小時(shí)內就確定是兩種根毛霉當中的一個(gè)種類(lèi)造成患者的真菌感染。
對研究結果進(jìn)行評論時(shí),作者說(shuō)道:
“這份報告強調了病理切片(Pathochip)作為在物種水平上確定微生物種類(lèi)的診斷工具的價(jià)值,特別是對那些很難在大多數臨床實(shí)驗室中得以確定的種類(lèi)。
它也將有助于醫生獲得關(guān)于患者感染狀況的關(guān)鍵印象以便于做出相關(guān)治療策略計劃。”
病理切片(Pathochip)“填補了新一代測序方法的空白”
研究人員指出,還有其他的方法——比如新一代測序方法——能夠識別未知病原體,但是這種技術(shù)也具有一些局限性。
例如,Robertson說(shuō),在進(jìn)行新一代測序的情況下,需要在組織樣本中存在高水平核酸以俚語(yǔ)確定病原體,且使用這種方法分析組織更為耗時(shí)。
“我們認為這項技術(shù)[病理切片(Pathochip)]在某些方面填補了新一代測序技術(shù)的空白,甚至能夠進(jìn)行更為精細的微調,因為我們檢測各種不同樣本的試劑或生物個(gè)體方面具有更高的靈敏度,無(wú)論是非生物或是生物,”Robertson說(shuō)。“比如,我們可以識別土壤、植物組織、動(dòng)物組織或人體組織中的樣本。”
病理切片(Pathochip承諾將致力于臨床應用,研究團隊說(shuō),還需要進(jìn)行更多的研究才能達到這個(gè)階段的要求。“這將需要進(jìn)行更為大量的研究,才能獲得批準在醫院臨床一線(xiàn)的最終應用,”Robertson補充說(shuō)。
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