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Nature發(fā)布突破性雙RNA測序技術(shù)的科研成果

2016-01-26 來(lái)源:健客網(wǎng)社區  標簽: 掌上醫生 喝茶減肥 一天瘦一斤 安全減肥 cps聯(lián)盟 美容護膚
摘要:Eunice Kennedy Shriver國家兒童健康與人類(lèi)發(fā)育研究所的Matthias Machner和Gisela Storz,在同一期的Nature雜志上發(fā)表了一篇“新聞與觀(guān)點(diǎn)”(News and Views)文章介紹這項研究工作。

  由來(lái)自德國、奧地利和美國的研究人員組成的一個(gè)研究小組發(fā)現,采用一種允許在感染過(guò)程中同時(shí)研究細菌與宿主小RNA的新技術(shù),可以揭示出兩者轉錄譜的改變。

  在發(fā)表于《自然》(Nature)雜志上的研究論文中,這一研究小組描繪了他們的技術(shù),為什么這一技術(shù)對于更多地了解細菌感染機制非常有用,以及在研究中獲得重要發(fā)現。

  EuniceKennedyShriver國家兒童健康與人類(lèi)發(fā)育研究所的MatthiasMachner和GiselaStorz,在同一期的Nature雜志上發(fā)表了一篇“新聞與觀(guān)點(diǎn)”(NewsandViews)文章介紹這項研究工作。

  Machner和Stortz指出,以往大多數的研究想更好地了解細菌感染宿主時(shí)發(fā)生的事件,都是將焦點(diǎn)放在細菌或是宿主的信使RNA上。在這項新研究中,研究人員采用了一種技術(shù)使得能夠同時(shí)聚焦兩者,從而能夠獲得感染初期階段和后期階段發(fā)生事件更完整的圖像。

  這一稱(chēng)作為雙RNA測序(dualRNA-seq)的方法,使得研究人員能夠同時(shí)研究宿主轉錄物和病原體信使RNAs——在這里,他們研究的對象是感染一種人類(lèi)細胞系的沙門(mén)氏菌。更特別地是,他們將焦點(diǎn)放在了一種叫做PinT的小RNA上,眾所周知在細菌開(kāi)始感染宿主細胞時(shí)PinT會(huì )激活。更細致的觀(guān)察揭示出它還調控了腸道沙門(mén)氏菌的一些基因,并有一些跡象表明它影響了宿主轉錄模式,轉而導致了一些長(cháng)鏈非編碼RNAs發(fā)生改變及激活了宿主細胞中其他一些信號通路。

  研究人員解釋說(shuō),這種雙RNA測序方法對細菌進(jìn)行了綠色熒光標記,使得在宿主細胞受到感染時(shí)能夠鑒別出細胞的一些部位。這一技術(shù)允許隨著(zhù)感染病程的發(fā)展研究來(lái)自?xún)煞N生物的信使RNA和非編碼RNAs轉錄物,以前所未有的角度觀(guān)測了這一過(guò)程。這一研究小組還記錄了他們的研究闡明感染過(guò)程中的小變化如何傳遍整個(gè)宿主系統,導致了感染宿主不同結局的過(guò)程。

  轉錄組是特定細胞或組織在特定時(shí)間或狀態(tài)下轉錄出來(lái)的所有RNA的集合。通過(guò)對轉錄組的研究可以揭示生物體的基因表達,研究結構變異及發(fā)現新基因。RNA測序作為一種新的轉錄組研究手段,利用新一代測序技術(shù)能夠更快速、準確地為人們提供更多的生物體轉錄信息。近年來(lái),這一方法在生物科學(xué)和醫學(xué)研究中非常流行,并正在逐漸走向臨床應用。

  前不久,中科院上海生科院神經(jīng)所的張旭研究員在十二月二十二日的CellResearch雜志上發(fā)表了新成果。他領(lǐng)導研究團隊根據單細胞RNA測序和功能異質(zhì)性鑒定了軀體感覺(jué)神經(jīng)元的類(lèi)型。

  由約翰霍普金斯大小華人科學(xué)家宋紅軍領(lǐng)導一個(gè)科學(xué)家小組報告稱(chēng),他們結合單細胞RNA測序和自身開(kāi)發(fā)出的生物信息學(xué)流程Waterfall,揭示出了成體神經(jīng)發(fā)生的分子級聯(lián)反應。這項重要的研究發(fā)布在2015年8月20日的《細胞干細胞》(CellStemCell)雜志上。

  來(lái)自同濟大學(xué)醫學(xué)院、加州大學(xué)洛杉磯分校、南昌大學(xué)等處的研究人員報告稱(chēng),他們利用單細胞RNA測序技術(shù),同時(shí)運用加權基因共表達網(wǎng)絡(luò )分析(WGCNA),揭示出了激活休眠神經(jīng)干細胞的信號。這一重要的研究結果發(fā)布在2015年的5月21日的《細胞》(Cell)雜志上。

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