2015年12月1-3日,在華盛頓特區召開(kāi)了一次大型國際會(huì )議,人類(lèi)基因組編輯的倫理學(xué)將會(huì )再次成為召開(kāi)的一個(gè)的主題。這次峰會(huì )將由美國國家科學(xué)院、美國國家醫學(xué)科學(xué)院、中國科學(xué)院和英國皇家學(xué)會(huì )聯(lián)合組織,這次會(huì )議中各國研究人員還將對人類(lèi)的基因組編輯的眾多問(wèn)題進(jìn)行討論;那么在即將過(guò)去的2015年里,基因編輯領(lǐng)域有哪些亮點(diǎn)研究呢?請看2015年基因編輯領(lǐng)域研究TOP10.
【1】GenomeBiol:改進(jìn)版CRISPR/Cas系統可對基因組進(jìn)行高效編輯
利用CRISPR/Cas系統進(jìn)行基因組編輯可以對小鼠受精卵中的小鼠基因組進(jìn)行直接地修飾,從而開(kāi)發(fā)出高效、快速、一步法產(chǎn)生,且不攜帶胚胎干細胞的基因敲除小鼠,相比有針對性地進(jìn)行靶向基因剔除,即進(jìn)行靶向基因插入的技術(shù)而言,這種利用CRISPR/Cas系統介導的基因組編輯技術(shù)目前而言仍然是一項比較艱巨的任務(wù)。
近日,來(lái)自東京醫科牙科大學(xué)的研究人員在國際雜志GenomeBiology上刊登了其最新的研究成果,他們通過(guò)開(kāi)發(fā)一種高效的CRISPR/Cas系統克服了當前的研究障礙,這種技術(shù)可以實(shí)現較長(cháng)基因盒的靶向插入,包括在受精卵中以高達50%的效率將增強綠色熒光蛋白插入到小鼠的基因組中。
文章中,研究人員再現了CRISPR/Cas系統的天然狀態(tài),其包括三種組分:Cas9蛋白、CRISPRRNA(crRNA)以及反義激活crRNA,這種新型系統取代了常見(jiàn)的利用兩種組分的系統,即Cas9mRNA和單一導向RNA(sgRNA);這種改進(jìn)的CRISPR/Cas系統可以提供便利高效的基因修飾,同時(shí)也可以成功傳遞給后代。
【2】Nature:進(jìn)化中的CRISPR技術(shù)又有新突破
來(lái)自哈佛醫學(xué)院和麻省總醫院的研究者們在最新一期Nature雜志上發(fā)表了他們新改進(jìn)的CRISPR-Cas9技術(shù),識別序列的范圍更大,識別也更為精準。文章第一作者BenjaminKleinstiver介紹說(shuō)新技術(shù)里的Cas9變種可以識別那些野生型Cas9無(wú)法修飾的人類(lèi)和斑馬魚(yú)基因的位點(diǎn),這使得CRISPR技術(shù)在多變的基因組里識別范圍大大增加。
CRISPR-Cas9核酸酶由Cas9蛋白和20個(gè)核苷酸長(cháng)的RNA分子組成。Cas9蛋白負責切斷DNA雙鏈,RNA分子用于識別目標序列,不過(guò)在目標序列旁邊還要有可以被Cas9識別的protospaceradjacentmotif(PAM)才能讓酶發(fā)揮作用。實(shí)驗室里通常使用的SpCas9來(lái)自于細菌Streptococcuspyogenes,它所需要的PAM序列一般為NGG形式,這在某種程度上限制了Cas9使用的范圍。
【3】張鋒Science重大突破:攻克CRISPR-Cas9基因組編輯的主要障礙
來(lái)自麻省理工學(xué)院-哈佛醫學(xué)院Broad研究所和麻省理工學(xué)院McGovern腦研究所的研究人員,設計改造了革命性的CRISPR-Cas9基因編輯系統,大大減少了“脫靶”編輯錯誤。這一完善的技術(shù)解決了使用基因組編輯時(shí)面對的一個(gè)主要技術(shù)問(wèn)題。
CRISPR-Cas9系統是通過(guò)對細胞的DNA進(jìn)行精確地靶向修飾來(lái)發(fā)揮作用。借助于與靶位點(diǎn)序列相匹配的一段短RNA分子,Cas9蛋白可改變指定位點(diǎn)的DNA。盡管Cas9能夠高度有效地切割它的靶位點(diǎn),這一系統有一個(gè)主要的缺點(diǎn):就是一旦進(jìn)入到細胞中,它可以結合并切割額外的非目標位點(diǎn)。這有可能會(huì )造成意外的編輯,完全改變基因表達或是敲除掉某一基因,導致癌癥形成或其他的問(wèn)題出現。
在發(fā)表于《科學(xué)》(science)雜志上的一篇新研究論文中,張鋒(FengZhang)和同事們報告稱(chēng),在構成化膿性鏈球菌Cas9酶的約1,400個(gè)氨基酸中,他們通過(guò)改變3個(gè)氨基酸將“脫靶編輯”顯著(zhù)減少至無(wú)法檢測到的水平。
【4】Nature:基因編輯引起軒然大波
坊間傳聞,已經(jīng)有人用精確的基因編輯技術(shù)改寫(xiě)了人類(lèi)胚胎的DNA。為此,美國再生醫學(xué)聯(lián)盟的主席EdwardLanphier聯(lián)合四位學(xué)者在三月十二日的Nature雜志上發(fā)表評論文章,號召研究者們暫時(shí)不要對人類(lèi)生殖細胞進(jìn)行基因編輯。因為用現有技術(shù)對人類(lèi)胚胎進(jìn)行基因編輯,可能對后代產(chǎn)生無(wú)法預測的后果。
“這樣的技術(shù)可能被利用,進(jìn)行非治療性的基因編輯。我們擔心這樣的倫理問(wèn)題會(huì )引起公眾抗議,影響基因編輯技術(shù)在醫療領(lǐng)域的美好前景,”Lanphier等人指出?;蚓庉嫾夹g(shù)的先驅FyodorUrnov也是這篇文章的作者之一。
現在有許多研究團隊正在嘗試用基因編輯工具(尤其是CRISPR)治療人類(lèi)的基因缺陷(比如校正白細胞)。他們擔心,用基因編輯制造“設計嬰兒”會(huì )使這一技術(shù)遭到全方位的抵制。
【5】我國科學(xué)家基因編輯人類(lèi)胚胎引爭議
2015年4月24日訊/生物谷BIOON/--最近科學(xué)界一直傳言有人正在進(jìn)行基因編輯人類(lèi)胚胎研究。而近日我國中山大學(xué)基因工程教育部重點(diǎn)實(shí)驗室副教授黃軍就及中山大學(xué)附屬第一醫院周燦權教授,在Protein&Cell發(fā)表了他們的課題組利用CRISPR/Cas9系統對人類(lèi)胚胎基因組改造的研究結果,證實(shí)了這個(gè)傳言,并由此引發(fā)了新一輪的倫理學(xué)爭論。
中山大學(xué)的研究人員利用了一種“不能存活”的受精卵來(lái)進(jìn)行研究。這種受精卵含有一個(gè)卵細胞和兩個(gè)精子的三個(gè)細胞核,從而不能正常發(fā)育成嬰兒。研究人員利用最近很火的CRISPR/Cas9系統來(lái)剪切受精卵中人的HBB基因(β-globingene),因為HBB基因突變會(huì )導致β地中海貧血癥。他們注射了86個(gè)三核受精卵,其中71個(gè)受精卵存活。在做檢測的54個(gè)樣品中,有28個(gè)受精卵的HBB被剪切了,而其中只有更小一部分被重組修飾了。不僅如此,非靶向的突變也出現了。
【6】基因編輯技術(shù)幫助治療“母系”遺傳病
你也許遺傳了你媽媽美麗的眼神,但同時(shí)她也給了你線(xiàn)粒體的DNA突變,所謂母系遺傳疾病的根源。一項基于小鼠的實(shí)驗表示可以通過(guò)兩種技術(shù)大幅降低卵子中有害DNA的風(fēng)險,從而使子女能夠逃避遺傳類(lèi)的疾病。此種方法也規避了存在倫理問(wèn)題的"線(xiàn)粒體置換技術(shù)"-該技術(shù)會(huì )導致"三親"型的胚胎。
盡管研究人員沒(méi)有在人類(lèi)胚胎中對此項技術(shù)進(jìn)行試驗,然而此項技術(shù)確實(shí)是"前所未有的"。來(lái)自美國南阿拉巴馬大學(xué)的分子生物學(xué)家MikhailAlexeyev認為此項試驗是第一次在受精卵中進(jìn)行的。
線(xiàn)粒體是細胞內產(chǎn)生能量的場(chǎng)所,這種細胞器含有自身的DNA,與細胞核內的大部分遺傳物質(zhì)相互隔離,但這并不是它們唯一的奇特之處。由于受精卵中的線(xiàn)粒體只能來(lái)自于卵子而非精子,所以線(xiàn)粒體是從母親遺傳下來(lái)的細胞器。然而,不幸的是沒(méi)200個(gè)女性中就有一個(gè)攜帶缺陷型的線(xiàn)粒體DNA,她們的子女從而會(huì )得一系列致死性的疾病,比如周期性嘔吐綜合征、Leigh綜合征等。
【7】PNAS:免疫細胞基因編輯給癌癥和艾滋病帶來(lái)希望
人類(lèi)中的很多突變都與基因突變相關(guān)。例如,白化病是因為酪氨酸酶基因上的點(diǎn)突變導致酪氨酸酶功能異常,從而導致了黑色素合成障礙。還有一些病癥涉及到多種基因突變導致的功能障礙。如果能夠使用某種精確的基因編輯方法,修補這些基因突變,從理論上講,就可以一定程度緩解病情。而人類(lèi)T細胞的基因突變導致其功能異常,會(huì )導致很多病癥的出現或者加重。
針對T細胞的基因改造,對于癌癥的免疫治療、艾滋病、免疫缺陷病、自身免疫病,都可能會(huì )帶來(lái)新的希望。美國加州舊金山的科學(xué)家們使用CRISPR/Cas9系統成功精確改造了人類(lèi)T細胞基因組,相關(guān)進(jìn)展發(fā)表在《美國科學(xué)院院刊》。他們利用Cas9對初級淋巴細胞的成功精確改造,是基因工程治療真正用于疾病治療的開(kāi)端,具有里程碑式的意義。
針對T淋巴細胞的基因改造的設想早已提出,并且從理論上,科學(xué)家們認為改造T淋巴細胞可能可以用于癌癥等多種疾病的治療。然而,改造T淋巴細胞的基因組并非易事,只有很少的細胞能夠完成基因組編輯?;蚋脑煜到y需要敲除T淋巴細胞內的一些基因,加入一些基因進(jìn)入基因組,還需要修復一些突變的基因位點(diǎn)
【8】NatMethods:新技術(shù)可顯著(zhù)提高基因編輯準確性
近日,來(lái)自美國哈佛大學(xué)的研究人員在國際學(xué)術(shù)期刊naturemethods發(fā)表了一項最新研究進(jìn)展,他們開(kāi)發(fā)了一種新技術(shù)能夠大大推動(dòng)基因組工程領(lǐng)域的發(fā)展,應用這一方法可以顯著(zhù)提高科學(xué)家們靶向特定錯誤基因,對其進(jìn)行"編輯",用健康DNA替換損傷遺傳密碼的能力。
基因組工程主要包括對基因進(jìn)行靶向和特定修飾,這一過(guò)程類(lèi)似于程序員編輯計算機代碼,或許有一天,科學(xué)家們也可以通過(guò)DNA編輯工具將損壞的或不健康的基因替換為健康基因。這一領(lǐng)域在過(guò)去二十年中已經(jīng)取得了巨大進(jìn)步,而在可見(jiàn)的未來(lái)還可能為醫療發(fā)展帶來(lái)革命性巨變。
目前,這一領(lǐng)域發(fā)展面臨的一個(gè)主要問(wèn)題在于如何確保工具蛋白只會(huì )影響需要修復的特定靶向基因。就現在的技術(shù)來(lái)說(shuō),絕大多數情況下工具蛋白能夠結合到特定基因對其進(jìn)行編輯,但科學(xué)家們仍然需要在保證基因編輯特異性方面做出共多努力。
【9】Cell:張鋒團隊基因編輯技術(shù)研究新突破
過(guò)去3年,CRISPR基因編輯技術(shù)成為生命科學(xué)領(lǐng)域的最熱門(mén)研究,因為利用這種簡(jiǎn)單的手段,科學(xué)家可以方便地對感興趣的基因進(jìn)行編輯,使基因編輯從過(guò)去高大上的尖端技術(shù)變成科學(xué)家的常用武器,也給人類(lèi)基因疾病的治療帶來(lái)希望。
利用這種技術(shù),科學(xué)家已經(jīng)先后成功對多種細胞,包括人類(lèi)胚胎細胞進(jìn)行了基因編輯。由于這種技術(shù)的簡(jiǎn)單方便,一些業(yè)余的生命科學(xué)研究愛(ài)好者都開(kāi)始使用這種技術(shù)進(jìn)行基因改造。幾乎所有人都認為,CRISPR基因編輯技術(shù)是最有希望問(wèn)鼎諾貝爾化學(xué)獎的研究。不過(guò)作為一種新技術(shù),仍然存在一些缺陷和不足,也就是說(shuō)仍然有改進(jìn)的潛力。
美國著(zhù)名華裔科學(xué)家MIT張鋒教授團隊是該領(lǐng)域的領(lǐng)先小組之一,最近發(fā)表論文提供了一種更好的CRISPR基因編輯工具,他們根據生物進(jìn)化理論,在細菌蛋白庫中尋找更理想的DNA切割酶,獲得了成功,使該技術(shù)超更簡(jiǎn)單、更便宜、更快、更準等方向上邁進(jìn)一大步。
【10】基因編輯技術(shù)讓豬產(chǎn)生人血白蛋白
以前,大型家畜精確的基因組改造只能通過(guò)冗長(cháng)和繁重克隆方法實(shí)現,不過(guò)現在這種方式將得到改變。北京蛋白質(zhì)組研究中心副主任張普民及其研究團隊利用CRISPR/Cas9基因修飾工具讓豬的體內產(chǎn)生人血白蛋白,這讓利用大型動(dòng)物生產(chǎn)生物醫藥產(chǎn)品或制造牲畜菌株成為可能。相關(guān)研究論文發(fā)表于12日在線(xiàn)出版的《科學(xué)報告》上。
人血白蛋白(簡(jiǎn)稱(chēng)HSA)是人血漿中的蛋白質(zhì),其在體液內可以運輸脂肪酸、膽色素、氨基酸等,并同時(shí)維持血液正常的滲透壓。在臨床上,人血白蛋白可用于治療休克與燒傷,用于補充因手術(shù)、意外事故或大出血所致的血液丟失,也可以作為血漿增容劑??蒲腥藛T曾經(jīng)嘗試在豬體內制造出人血白蛋白,但是由于無(wú)法避免豬白蛋白的產(chǎn)生,這使得分離與提純人血白蛋白具有很大挑戰。
隨著(zhù)CRISPR/Cas9基因修飾工具的誕生,編輯基因組不再是難事。張普民及其研究團隊利用該基因修飾工具對豬受精卵的基因組進(jìn)行了基因編輯。他們在產(chǎn)生豬白蛋白的基因區域插入了人類(lèi)生產(chǎn)白蛋白的DNA編碼(又稱(chēng)為敲入等位基因)。為了讓豬只產(chǎn)生人血白蛋白而不產(chǎn)生豬白蛋白,研究人員將敲入的等位基因位于豬白蛋白產(chǎn)生基因的下游。