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Cancer cell:人類(lèi)癌癥中長(cháng)非編碼RNA全解讀

2015-10-19 來(lái)源:健客網(wǎng)社區  標簽: 掌上醫生 喝茶減肥 一天瘦一斤 安全減肥 cps聯(lián)盟 美容護膚
摘要:研究人員指出:"在知曉了組成基因組四分之三的都是非編碼RNA序列之后,人們對于深入了解基因組,表觀(guān)遺傳以及長(cháng)非編碼序列如何變化有著(zhù)極大需求,而這項研究恰恰填補了癌癥研究中的這一空白。"

  人類(lèi)基因組包含大約20,000個(gè)蛋白編碼基因,但這些基因只占人類(lèi)基因組的不到2%,而基因組的70%都用以合成非編碼RNA,但到目前為止,仍然缺少系統性描述長(cháng)非編碼RNA在人類(lèi)癌癥中變化的研究。大部分對癌癥基因組變化的研究都聚焦在編碼蛋白的一小部分基因組。

  最近,來(lái)自美國賓夕法尼亞大學(xué)的一支國際研究團隊在國際學(xué)術(shù)期刊cancercell上發(fā)表了一項最新研究進(jìn)展,他們深入挖掘了與13種不同類(lèi)型癌癥有關(guān)的非蛋白編碼RNA序列。

  研究人員指出:"在知曉了組成基因組四分之三的都是非編碼RNA序列之后,人們對于深入了解基因組,表觀(guān)遺傳以及長(cháng)非編碼序列如何變化有著(zhù)極大需求,而這項研究恰恰填補了癌癥研究中的這一空白。"

  在這項研究中,研究人員在轉錄,基因組和表觀(guān)遺傳水平上對不同類(lèi)型的超過(guò)5000份腫瘤樣品以及935種癌細胞系中的lncRNA進(jìn)行了分析,他們發(fā)現相比于蛋白編碼基因,lncRNA的變化存在高度的腫瘤和細胞系特異性,除此之外,lncRNA的變化還常與直接影響基因表達的表觀(guān)遺傳修飾改變存在關(guān)聯(lián)。

  該研究團隊還開(kāi)發(fā)了兩個(gè)生物信息平臺幫助發(fā)現癌癥相關(guān)lncRNA并進(jìn)一步探究其功能。其中一個(gè)是可搜索數據庫,其中收錄了與lncRNA分子改變相關(guān)聯(lián)的臨床信息,能夠幫助研究人員獲得候選lncRNA的列表。另外一個(gè)是用于預測lncRNA生物學(xué)功能的平臺,研究人員利用這一平臺成功發(fā)現了一個(gè)新的致癌lncRNA,如果這種lncRNA出現異常過(guò)表達就會(huì )促進(jìn)細胞周期進(jìn)行,導致癌癥發(fā)生。

  癌細胞基因組中,lncRNA會(huì )在多個(gè)層面上發(fā)生失調,并且這些改變具有非常顯著(zhù)的癌癥類(lèi)型特異性,這項研究為這一觀(guān)點(diǎn)提供了充分證據。研究人員希望他們的工作能夠幫助其他科學(xué)家發(fā)現更多有關(guān)lncRNA的秘密。

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