99色热,九九热国产,99视频在线观看视频,99视频在线观看视频,亚洲视频99,久久99久久98精品免观看软件,99视频观看

您的位置:健客網(wǎng) > 新聞頻道 > 醫藥資訊 > 醫藥科研 > 北京基因組所合作開(kāi)發(fā)完成基因排布可視化工具

北京基因組所合作開(kāi)發(fā)完成基因排布可視化工具

2015-08-25 來(lái)源:健客網(wǎng)社區  標簽: 掌上醫生 喝茶減肥 一天瘦一斤 安全減肥 cps聯(lián)盟 美容護膚
摘要:現今,二代測序技術(shù)的快速發(fā)展和廣泛應用,產(chǎn)生了不同分類(lèi)群代表物種的基因組數據,但是缺乏一個(gè)基于大規?;蚪M數據且操作簡(jiǎn)單的基因排布可視化工具。

  基因在染色體上的排布(GeneOrders)是高度組織化的,在自然選擇作用下,單一基因的結構和成簇基因的排列順序在不同進(jìn)化分支中具有不同程度的可變性,并且基因排布與染色體結構的關(guān)系仍然有待進(jìn)一步探索。進(jìn)化基因組學(xué)的重要研究?jì)热葜痪褪墙沂驹谶@些大規模且不同程度的基因排布下,不同物種基因組在基因共調控機制方面的相似和差異?,F今,二代測序技術(shù)的快速發(fā)展和廣泛應用,產(chǎn)生了不同分類(lèi)群代表物種的基因組數據,但是缺乏一個(gè)基于大規?;蚪M數據且操作簡(jiǎn)單的基因排布可視化工具。

  為此,中國科學(xué)院北京基因組研究所基因組科學(xué)與信息重點(diǎn)實(shí)驗室研究員于軍和英國倫敦大學(xué)學(xué)院腫瘤研究所王大鵬合作開(kāi)發(fā)了一套全新的網(wǎng)絡(luò )可視化工具LCGserver,用于解析多類(lèi)群進(jìn)化背景下基因排布的動(dòng)態(tài)變化規律,此項研究于近期發(fā)表在OMICS:AJournalofIntegrativeBiology雜志。

  針對基因排布,LCGserver提供三個(gè)水平的分析功能:?jiǎn)蝹€(gè)基因、成對基因和成簇基因。其獨特的功能是可以根據成組基因的同源性將不同的基因組進(jìn)行比對,幫助用戶(hù)直觀(guān)地鑒定特定物種基因組在特定進(jìn)化分支上基因排布的保守和變異事件。另外,根據保守和變異的所有可能性,將成對基因分成6種模式并且可以識別完全保守的基因簇的存在。

  此項研究將對進(jìn)化和比較基因組學(xué)領(lǐng)域產(chǎn)生積極影響,比如研究新測序物種基因組和公共數據庫基因組的基因共線(xiàn)性關(guān)系,通過(guò)比較近緣物種基因組查看并糾正組裝過(guò)程中存在的問(wèn)題,通過(guò)基因位置信息構建物種進(jìn)化樹(shù),與RNA-Seq數據結合進(jìn)行基因位置和基因共表達的交叉驗證,高度保守的基因簇可以作為高維基因組結構的錨點(diǎn)等。

看本篇文章的人在健客購買(mǎi)了以下產(chǎn)品 更多>
有健康問(wèn)題?醫生在線(xiàn)免費幫您解答!去提問(wèn)>>
健客微信
健客藥房
溧阳市| 义乌市| 新邵县| 瓦房店市| 察哈| 巴马| 张家口市| 循化| 平顶山市| 巴林右旗| 比如县| 东山县| 石门县| 黄山市| 平阳县| 皋兰县| 临澧县| 龙岩市| 鸡西市| 永仁县| 柳河县| 长春市| 平凉市| 中宁县| 宁安市| 汉川市| 宁德市| 东方市| 琼海市| 常德市| 广安市| 佳木斯市| 曲阳县| 寿光市| 静安区| 连江县| 西贡区| 孟村| 西安市| 南涧| 菏泽市|