普遍認為，自閉癥病因尚不清楚，可能與以下因素有關(guān)：

　　1、遺傳

　　遺傳因素對孤獨癥的作用已趨于明確，但具體的遺傳方式還不明了。

　　2、圍產(chǎn)期因素

　　圍產(chǎn)期各種并發(fā)癥，如產(chǎn)傷、宮內窒息等較正常對照組多。

　　3、免疫系統異常

　　發(fā)現T淋巴細胞數量減少，輔助T細胞和B細胞數量減少、抑制-誘導T細胞缺乏、自然殺傷細胞活性減低等。

　　4、神經(jīng)內分泌和神經(jīng)遞質(zhì)

　　與多種神經(jīng)內分泌和神經(jīng)遞質(zhì)功能失調有關(guān)。研究發(fā)現孤獨癥患者的單胺系統，如5-羥色胺（5-HT）和兒茶酚胺發(fā)育不成熟，松果體-丘腦下部-垂體-腎上腺軸異常，導致5-HT、內啡肽增加，促腎上腺皮質(zhì)激素（ACTH）分泌減少。