少數自閉癥患兒的cT檢查發(fā)現顯著(zhù)異常，如兩側大腦半球不對稱(chēng)、腦室擴大、腦體積增大等。有些研究還發(fā)現大腦半球偏側優(yōu)勢化倒轉，較多發(fā)現腦室擴大。但多數患兒無(wú)此現象。腦體積增大，可能系腦組織和側腦室共同增大的結果，可能的機制是神經(jīng)細胞生長(cháng)增加，神經(jīng)細胞死亡減少，或非神經(jīng)細胞性腦組織和血管的產(chǎn)生增加。

　　Gaffney等(1987)對4～22歲IQ60分或稍高的14例自閉癥患者做頭部磁共振(MRI)檢查，發(fā)現6例有腦損傷。MRI矢狀正中線(xiàn)掃描發(fā)現自閉癥患者與對照組比較顯示第四腦室明顯擴大，并且整個(gè)腦干明顯縮小，冠狀掃描顯示自閉癥患者小腦明顯縮小，第四腦室明顯擴大。MRI發(fā)現的小腦異常與尸體解剖顯微鏡檢查的結果是一致的。但小腦異常與自閉癥的聯(lián)系尚不明確。

　　正電子發(fā)射體層攝影(PET)顯示額葉、頂葉、新紋狀體及上丘腦功能受損。單光子發(fā)射計算機體層顯像(SPEcT)的研究，Rumsey等(1985)對10例男性自閉癥患兒與對照組比較，發(fā)現腦的很多部位葡萄糖利用率明顯提高。但例數過(guò)少，尚不足說(shuō)明問(wèn)題。Mountz等(1995)也發(fā)現大腦皮質(zhì)的額葉、頂葉血流灌注降低，且以左側半球更為明顯。另一項縱向對照研究發(fā)現，自閉癥患兒額葉皮質(zhì)存在階段性血流灌注降低，提示額葉功能成熟延遲。舒明躍(2001)對86例自閉癥患兒進(jìn)行sPEcT檢測，發(fā)現75％的患兒sPEcT檢查有異常發(fā)現，且主要表現為局部放射性分布減低。這種異常雖見(jiàn)于大腦皮質(zhì)、小腦和皮質(zhì)下多處結構，但主要集中在額葉、顳葉的皮質(zhì)，以左側額葉最為常見(jiàn)。這些部位存在局部腦血流灌注和(或)細胞功能障礙，它們與臨床上表現出的認知、言語(yǔ)和情感障礙在大體解剖的功能定位上是一致的，其病理意義及診療價(jià)值值得進(jìn)一步探討。