病因包括生物醫學(xué)因素和社會(huì )心理文化原因。前者指腦在發(fā)育過(guò)程中(產(chǎn)前和圍前期)接受到的各種不利因素，它們可使腦的發(fā)育不能達到應有水平，最終影響智力。后者指文化剝奪、教養不當、感覺(jué)剝奪等因素可使后天信息輸入不足或不適當，從而影響智力水平。依據WHO1985年分類(lèi)法和全國協(xié)作組的調查結果，病因分為以下類(lèi)型。

　　1、感染、中毒 占12.3%。感染指出生前、后的腦部感染，如風(fēng)疹、巨細胞病毒、弓形體、單純皰疹病毒及其他多種病毒感染。中毒包括高膽紅素血癥、毒血癥、鉛中毒、酒精中毒以及長(cháng)期服用過(guò)量的苯妥英鈉或苯巴比妥等藥物。

　　2、腦的機械損傷和缺氧 占19.6%。出生前、后及分娩時(shí)都可因物理或機械因素造成腦損傷，如產(chǎn)傷、顱腦外傷。圍產(chǎn)期或生后缺血缺氧也可損害腦組織，如孕婦嚴重失血、貧血、心力衰竭、肺部疾患和新生兒窒息、顱內出血等，以及溺水、麻醉意外、癲癇持續發(fā)作后的腦缺氧。

　　3、代謝、營(yíng)養和內分泌疾患 占5.8%。體內氨基酸、碳水化合物、脂肪、粘多糖、嘌呤等物質(zhì)代謝出現障礙都可影響神經(jīng)細胞的發(fā)育及功能，如苯丙酮尿癥、半乳糖血癥。生前、生后營(yíng)養不足特別是蛋白質(zhì)、鐵等物質(zhì)缺乏將會(huì )使胎兒、嬰兒的腦細胞數目形成減少或功能低下。內分泌疾患也要影響智力發(fā)育，如甲狀腺功能低下。

　　4、腦部大體疾病 占0.7%。包括腫瘤、不明原因的變性疾病、神經(jīng)皮膚綜合征、腦血管病等。

　　5、腦的先天畸形或遺傳性綜合征 占9.5%。先天畸形包括腦積水、水腦畸形、頭小畸形、神經(jīng)管閉合不全、腦的我發(fā)畸形等。遺傳性綜合征如腎上腺腦白質(zhì)營(yíng)養不良等。

　　6、染色體畸變 占5.1%。染色體畸變包括常染色體或性染色體的數目或結構改變，如先天愚型、18三體綜合征、C組三體綜合征、貓叫綜合征、脆性X綜合征、先天性睪丸發(fā)育不全綜合征、先天性卵巢發(fā)育不全綜合征。

　　7、圍產(chǎn)期其他因素 占11.8%。包括早產(chǎn)兒、低出生體重兒、胎兒宮內生長(cháng)發(fā)育遲緩、母親營(yíng)養疾病、妊高癥等。

　　8、伴發(fā)于精神病 如嬰兒孤獨癥、兒童期精神分裂癥。

　　9、社會(huì )心理因素 占8.2%。此類(lèi)患兒沒(méi)有腦的器質(zhì)性病變，主要由神經(jīng)心理?yè)p害和感覺(jué)剝奪等不良環(huán)境因素造成，如嚴重缺乏早期合適刺激和教育。

　　10、特殊感官缺陷 占5.1%。包括聾、啞、盲等特殊感官缺陷。

　　11、病因不明 占21.9%。經(jīng)過(guò)詳細檢查而找不到任何病因線(xiàn)索，即為病因不明。