1.非手術(shù)治療：對癥狀輕、發(fā)作不頻繁者，試用抗感染和利膽治療。
2.手術(shù)治療：原則是修復或重建膽道，膽腸內引流術(shù)可附加防反流措施。
術(shù)前進(jìn)行多種、多方位的膽系和胃腸道影像學(xué)檢查，術(shù)中探查以排除肝內膽管結石、狹窄等其他引起膽管炎的疾患，明確反流性膽管炎的診斷。
對于已行膽腸吻合術(shù)后發(fā)生反流性膽管炎患者，發(fā)生反流性膽管炎往往潛伏著(zhù)手術(shù)失敗的危險，對于原發(fā)疾病治療當中行膽道內引流時(shí)，手術(shù)方式較多，但臨床證明，以膽道空腸Roux-en-Y為優(yōu)。但同樣存在發(fā)生反流性膽管炎之慮，它的發(fā)生可能與吻合口自身的缺陷，輸出腸襻腸管盲端較長(cháng)，空腸襻的曠置長(cháng)度不夠長(cháng)及抗反流作用不足有關(guān)。對于膽道內引流術(shù)中的抗反流問(wèn)題，有許多抗反流的術(shù)式，如腸襻的Roux-en-Y吻合、改良“Y”腸腸吻合口角度、在輸出腸管上加做人工腸套疊或人工乳頭等，這些抗反流的效果如何及哪種術(shù)式較好，存在異議。在臨床上腸襻Roux-en-Y膽腸吻合應用較多，但有的作者據實(shí)驗研究的結果顯示，輸出腸襻從最短20cm到75cm之間抗反流作用無(wú)顯著(zhù)性差異，即便輸出腸襻長(cháng)度達100cm也不能完全預防反流性膽管炎的發(fā)生，目前，多數作者選擇曠置腸管的長(cháng)度大致50~60cm之間。為了加強抗反流作用，在腸腸吻合后使之成“Y”形，做法是將兩個(gè)空腸襻在并行位置縫合 6~8cm長(cháng)，以促近端腸內的食糜順蠕動(dòng)排至遠端空腸內，但也有報道如果抗反流作用強，則對膽石排出的力量就弱。因此，對肝內膽管結石病人加抗反流裝置時(shí)要權衡利弊。
具體的手術(shù)方法選擇視病情而定，手術(shù)探查及影像學(xué)檢查證實(shí)原膽腸吻合口狹窄或已完全閉塞，以及在吻合口近端存在狹窄和結石，此時(shí)，原吻合口已失去意義，取盡結石和糾正肝內膽管的狹窄，并建立起新的通暢的引流，在重建內引流過(guò)程中遇膽總管和肝內膽管狹窄時(shí)，應予切開(kāi)成形，防止術(shù)后再狹窄。對于可能由于膽腸“Y”形吻合腸襻過(guò)短引起的反流，在治療上相對簡(jiǎn)單，將腸襻延長(cháng)即解決了反流的問(wèn)題。