首先應重視對該病的預防。人的包囊蟲(chóng)病多經(jīng)狗傳染，應控制養狗。加強牲畜管理，嚴防狗食染有包囊蟲(chóng)病的生牛、羊、馬肉。注意個(gè)人衛生，不飲用生水、生乳，尤其在牧區。
骨包蟲(chóng)病的治療方法主要是切除病骨。但有時(shí)難以將全部的病變骨徹底切除時(shí)，可采用刮除植骨的手術(shù)的方法。即徹底清除病灶后，腔內用20%的石炭酸甘油涂擦腔壁，10分鐘后再用90%酒清擦洗滅活，然后用生理鹽水反復沖洗骨腔再植入碎骨片。但手術(shù)中要特別注意防止子囊的擴散及囊液外流引起過(guò)敏性休克的危險。病灶刮除后，留置引流管，每日滴注20%～30%的高滲氯化鈉溶液，可以殺死頭節，效果良好。
晚期病變廣泛的患者，難于局部切除或刮除者，可考慮做關(guān)節離斷術(shù)或截斷術(shù)，但骨病變較長(cháng)而軟組織尚無(wú)廣泛受侵時(shí)可做假體置換術(shù)。脊柱受侵時(shí)應及時(shí)早期清除病灶并植骨。合并截癱時(shí)則應徹底清除病灶并做脊髓減壓及應用器械內固定術(shù)，做植骨融合。