本病癥狀有血精，射精后會(huì )陰部疼痛，尿道血性分泌物，血尿、尿頻、尿痛，較大者可有腹部疼痛、排尿障礙，直腸指診或雙合診可能觸及囊性腫物。
診斷首先依據臨床癥狀和直腸指診。精囊較大的囊腫常被誤診為尿潴留或充盈的膀胱，但插入導尿管卻收集不到尿液，直腸指診，腹部雙合診在前列腺上方可捫及腫塊。

精囊囊腫還需與精囊癌相鑒別，精囊癌極少見(jiàn)，大多數繼發(fā)于前列腺、膀胱、直腸或附近的組織。加藤哲郎等認為囊腫可能合并惡性腫瘤，應加以仔細鑒別。直腸指診時(shí)可捫及堅硬結節，不規則的梭形腫塊，膀胱鏡檢查可見(jiàn)整個(gè)膀胱底部及三角區抬高，而致膀胱頸梗阻，并有原發(fā)病癥狀，精囊造影可明確腫瘤與精囊的關(guān)系。
本病還需與前列腺囊腫，包蟲(chóng)性囊腫，膀胱憩室和精囊炎相鑒別，后者經(jīng)直腸指診，CT，B超常能區分，精囊造影和膀胱鏡檢可資鑒別。