沙眼衣原體新生兒肺炎主要見(jiàn)于2～12周新生兒及嬰兒，大多數無(wú)發(fā)熱，起始癥狀通常是鼻炎、伴鼻腔黏液性分泌物和鼻塞。隨后發(fā)展為斷續的咳嗽，呼吸急促，可聞及肺部啰音，可伴有心肌炎和胸腔積液。半數患兒可伴有急性包涵體性結膜炎。成人免疫抑制患者可見(jiàn)咽炎、支氣管炎和肺炎等呼吸道感染，可有干咳、發(fā)熱、肌痛、寒戰、咯血和胸痛。肺部X線(xiàn)顯示為間質(zhì)浸潤，亦可見(jiàn)支氣管肺炎或網(wǎng)狀、結節樣陰影。
沙眼衣原體肺部感染的臨床癥狀及X線(xiàn)表現均無(wú)特異性，故確診有賴(lài)于實(shí)驗室診斷。
1.最可靠的方法是進(jìn)行沙眼衣原體的培養，取鼻咽部或咽后壁拭子、氣管和支氣管吸出物、肺泡灌洗液等標本培養，新生兒沙眼衣原體肺炎可同時(shí)取眼結膜刮屑物培養和(或)涂片直接熒光法(DFA)檢測沙眼衣原體。分離物可用沙眼衣原體種特異性單克隆抗體進(jìn)行鑒定。
2.應用PCR試驗對上述標本進(jìn)行檢測對診斷有很大幫助，但需要注意質(zhì)量控制，防止出現假陽(yáng)性結果。
3.微量免疫熒光試驗(MIF)是目前國際上標準的且是最常用的沙眼衣原體血清學(xué)診斷方法，尤其適用于新生兒和嬰兒沙眼衣原體肺炎的診斷，因為可檢測出患兒血清中存在高水平的非母體IgM抗體(不通過(guò)胎盤(pán)屏障)。血清學(xué)診斷標準為：MIF試驗IgG≥1∶512和(或)IgM≥1∶32，在排除類(lèi)風(fēng)濕因子(RF)所致的假陽(yáng)性后可診斷為近期感染，雙份血清抗體滴度4倍或以上升高也診斷為近期感染。

本病應注意與病毒性肺炎或支原體肺炎相鑒別。