Barrett食管可發(fā)生嚴重的并發(fā)癥，良性并發(fā)癥包括反流性食管炎、食管狹窄、潰瘍、穿孔、出血和吸入性肺炎等.
常見(jiàn)的并發(fā)癥有：
1.潰瘍 Barrett食管引起潰瘍的發(fā)病率為2%～54%，食管柱狀上皮受酸性消化液腐蝕后可以發(fā)生潰瘍，出現類(lèi)似胃潰瘍的癥狀，疼痛可放射至背部，并可引起穿孔、出血、浸潤、潰瘍愈合后發(fā)生狹窄，出現下咽不暢的癥狀。甚至可穿透主動(dòng)脈導致大出血而迅速致死。Barrett潰瘍的病理分型有兩種，最為常見(jiàn)的為發(fā)生在鱗狀上皮段的淺表性潰瘍，這種類(lèi)型與因反流性食管炎引起的潰瘍相似。另一種少見(jiàn)的為發(fā)生在柱狀上皮段的深大潰瘍，與消化性潰瘍相似。
2.狹窄 食管狹窄是Barrett食管最常見(jiàn)的并發(fā)癥，發(fā)生率為15%～100%。狹窄部位多于食管中上段的鱗-柱狀上皮交界處，而胃食管反流引起的狹窄多位于食管下段。反流性食管炎的發(fā)生率為29%～82%。病變可單獨累及柱狀上皮，也可同時(shí)累及鱗狀和柱狀上皮。
3.惡變 Barrett食管中發(fā)生癌腫的發(fā)生率不甚確切，長(cháng)期反流物進(jìn)入Barrett食管可能起惡變作用。但有研究認為Barrett食管病病人施行了抗反流手術(shù)亦不能使這些柱狀上皮消退，亦不減少惡變的危險性。Barrett食管的柱狀上皮區內可以發(fā)生異型增生，程度可自低度到高度，有時(shí)低度異型增生不易與正常柱狀上皮區別，高度異型增生與原位癌有時(shí)難予區別，并可進(jìn)展至浸潤癌。這些惡變的腫瘤系腺癌。需要指出的是內鏡發(fā)現賁門(mén)腺癌伴有良性柱狀上皮與柱狀上皮異型增生為腺癌是有區別的。Barrett食管的異型增生是癌前期狀況已為多數人公認。
4.胃腸道出血 可表現為嘔血或便血，并伴有缺鐵性貧血，發(fā)生率約為45%，其出血來(lái)源為食管炎和食管潰瘍。