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Nature子刊:用高通量免疫測序診斷病毒感染

2017-04-06 來(lái)源:藥明康德  標簽: 掌上醫生 喝茶減肥 一天瘦一斤 安全減肥 cps聯(lián)盟 美容護膚
摘要:AdaptiveBiotechnologies是高通量測序領(lǐng)域的先驅性公司和領(lǐng)軍企業(yè)之一,其專(zhuān)長(cháng)于結合生物信息學(xué)來(lái)鑒定分析T細胞和B細胞受體。

  今天,藥明康德合作伙伴AdaptiveBiotechnologies宣布在《自然》子刊《NatureGenetics》上發(fā)表創(chuàng )新型研究論文,結果證明可提供一種潛在的新穎方法診斷慢性病毒感染。

  AdaptiveBiotechnologies是高通量測序領(lǐng)域的先驅性公司和領(lǐng)軍企業(yè)之一,其專(zhuān)長(cháng)于結合生物信息學(xué)來(lái)鑒定分析T細胞和B細胞受體。這家公司的immunoSEQ平臺幫助科研人員在腫瘤學(xué)、自身免疫疾病、傳染病和基礎免疫學(xué)等領(lǐng)域展開(kāi)前沿研究。以服務(wù)或試劑盒形式,immunoSEQ測定方法可以高度精細地從單個(gè)樣品中鑒定分析數百萬(wàn)個(gè)T細胞和B細胞受體。該immunoSEQ平臺分析工具可提供定量、可重復的測序結果,加上其強大的訪(fǎng)問(wèn)功能以及易于使用的特性,Adaptive免疫測序平臺的準確性和靈敏度優(yōu)勢已經(jīng)逐步入駐世界各地的實(shí)驗室,推動(dòng)癌癥和其他免疫介導疾病的突破性研究;同時(shí),該公司也將免疫測序發(fā)現轉化為臨床診斷和治療手段,以改善患者的護理水平。

  這篇題為“ImmunosequencingidentifiessignaturesofcytomegalovirusexposurehistoryandHLA-mediatedeffectsontheTcellrepertoire”的文章正是描述了Adaptive的計算生物學(xué)家如何使用該公司的immunoSEQ平臺和數據集,通過(guò)免疫測序手段來(lái)確定分析T細胞受體譜系,最終用于診斷人類(lèi)巨細胞病毒(CMV)感染的暴露狀態(tài)。

  Adaptive的這項研究是由FredHutchinson癌癥研究中心部分資助的。研究共同作者選擇了CMV進(jìn)行原理驗證實(shí)驗,這是因為該疾病約占成年人慢性病毒感染的30%?90%,并被廣泛研究后建立成為公眾人群T細胞應答的模型系統。使用公共數據,Adaptive的研究團隊分析了666名受試者核心隊列的T細胞受體全譜系,以及另外120名受試者的獨立驗證隊列。研究小組制定了一個(gè)統計計算框架,通過(guò)CMV感染狀態(tài)對受試者進(jìn)行分類(lèi),然后高精度確認了免疫測序方法可被用于診斷CMV的感染狀態(tài)。此外,該團隊使用這種方法證明它在預測受試者的人類(lèi)白細胞抗原(HLA)等位基因方面也表現良好,表明該方法可用于識別暴露于其他病原體的生物標志,甚至疫苗接種狀態(tài)。

  AdaptiveBiotechnologies的聯(lián)合創(chuàng )始人兼創(chuàng )新主管HarlanRobins博士說(shuō)道:“我們認為通過(guò)讀取T細胞記憶來(lái)推斷病原體暴露歷史的方法具有令人興奮的潛力。這是一個(gè)重要步驟,我們旨在將免疫測序驗證為針對各種慢性病毒感染的高敏感度、高特異性和高效益的診斷方法。”

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