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ctDNA與癌癥早篩,這項新突破是否會(huì )帶來(lái)顛覆?

2017-03-09 來(lái)源:生物探索  標簽: 掌上醫生 喝茶減肥 一天瘦一斤 安全減肥 cps聯(lián)盟 美容護膚
摘要:研究人員將10種不同正常組織(肝、小腸、結腸、肺、腦、腎、胰、脾、胃和血液)完整的CpG甲基化模式整合在一起,還分析了來(lái)自于UCSDMoores癌癥中心的患者腫瘤樣品和血液樣品,以構建癌癥特異性遺傳標記數據庫。

  ctDNA已被證明與腫瘤實(shí)時(shí)變化密切相關(guān),已被用于評估耐藥性、監測治療反應等。近年來(lái),利用ctDNA液體活檢來(lái)早期診斷癌癥的研究熱度不斷攀升,成果也越來(lái)越顯著(zhù)。

  ctDNA液體活檢與甲基化檢測全新組合

  這項新技術(shù)的核心是將腫瘤ctDNA液體活檢與甲基化檢測組合,以DNA中甲基化的CpG島作為特定的檢測標簽。甲基化CpG島是指將甲基基團添加到DNA分子中的CG序列;并且身體中的每個(gè)組織可以通過(guò)其獨特的CpG甲基化標簽來(lái)鑒定。

  研究人員將10種不同正常組織(肝、小腸、結腸、肺、腦、腎、胰、脾、胃和血液)完整的CpG甲基化模式整合在一起,還分析了來(lái)自于UCSDMoores癌癥中心的患者腫瘤樣品和血液樣品,以構建癌癥特異性遺傳標記數據庫。

  突破點(diǎn):不僅早期篩查癌癥,還能確定癌癥的位置

  這項技術(shù)由美國加利福尼亞圣地哥分校生物工程系張鹍教授及其團隊開(kāi)發(fā),不僅可以檢測癌癥,還能確定腫瘤在體內的生長(cháng)位置,這種方法為癌癥早期診斷提供了新方向,并且無(wú)須進(jìn)行侵入性手術(shù),如組織活檢等。腫瘤ctDNA液體活檢與甲基化檢測的全新組合,會(huì )重新修改我們對“腫瘤早篩”這一概念的認識。

  此前的血液檢測通過(guò)篩選死亡癌細胞釋放的ctDNA來(lái)實(shí)現癌癥檢測的目的,這種方法用于追蹤腫瘤痕跡十分具有潛力,然而,它往往不會(huì )告訴你腫瘤的具體部分。張鹍教授表示,了解腫瘤的位置是早期篩查的關(guān)鍵。

  在這項研究中,張鹍教授及其團隊在血液中發(fā)現了一條新的線(xiàn)索,既可以檢測腫瘤細胞,還可以識別腫瘤細胞的位置。當腫瘤開(kāi)始在身體中生長(cháng)時(shí),它會(huì )與正常細胞競爭營(yíng)養和空間,并在競爭過(guò)程將正常細胞殺死。當正常細胞死亡時(shí),它們會(huì )將DNA釋放到血液中,這些DNA可用來(lái)識別受影響的組織。

  張鹍教授表示,發(fā)現這種方法是偶然的。最初他們采用的是傳統方法來(lái)尋找癌細胞信號,并試圖尋找這些信號的來(lái)源,同時(shí)他們也看到了其他細胞的信號。他們意識到,如果把這兩組信號結合在一起,就可以確定腫瘤是否存在以及它們長(cháng)在哪里。

  張鹍教授及其團隊篩選了正常樣本和腫瘤樣本,以尋找腫瘤標記物和組織特異性甲基化的信號,檢測方式類(lèi)似于雙重身份驗證過(guò)程。他說(shuō):“為了將這項研究推向臨床階段,我們需要與醫生合作,進(jìn)一步優(yōu)化和完善這種方法。”

  成ctDNA與癌癥早期篩查

  血漿DNA(ctDNA/cfDNA)應用于無(wú)創(chuàng )早篩大家都已不陌生。隨著(zhù)基礎及臨床科研的蓬勃發(fā)展,血漿DNA在DNA水平上代表了整個(gè)腫瘤基因組的特征,對于癌癥的檢測可以覆蓋常見(jiàn)的腫瘤。除了發(fā)現腫瘤的高危人群,還可應用于癌癥術(shù)后病人腫瘤基因突變情況的實(shí)時(shí)動(dòng)態(tài)監控;并隨著(zhù)PCR和高通量測序技術(shù)的優(yōu)化,現在越來(lái)越能達到高靈敏度,高準確度的檢測。

  最新的這篇《NatureGenetics》文章將血漿DNA液體活檢與甲基化檢測相結合,不僅能做到癌癥的早期篩查,更能確定癌癥的組織來(lái)源。處在液體活檢研究一線(xiàn)的凱杰(蘇州)轉化醫學(xué)研究有限公司王瑜博士在接受生物探索采訪(fǎng)時(shí)表示,這項技術(shù)的思路與原理,與無(wú)創(chuàng )產(chǎn)前檢測(NIPT)奠基人盧煜明教授2015年在《PNAS》上發(fā)表的全基因組甲基化測序推動(dòng)cfDNA在癌癥診斷、移植后的監測等多領(lǐng)域應用很相似,更加支持了血漿DNA在癌癥早篩領(lǐng)域中樂(lè )觀(guān)的應用前景。

  然而,ctDNA應用于液體活檢存在許多挑戰,王瑜博士表示,不同個(gè)體的ctDNA水平差異較大,對ctDNA的檢測要求較高的靈敏度;檢測標準、哪些biomarker可做為尋找的目標、罕見(jiàn)變異的臨床意義等的界定還需大量臨床信息的積累;測序的成本目前還較高;測序技術(shù)及結果解讀上的一些細節也還在完善以避免誤差的產(chǎn)生,這些都是ctDNA液體活檢需要克服的點(diǎn)。

  王瑜博士認為,ctDNA癌癥早期篩查的臨床前景很明確。因其可以被定性,定量和追蹤,并越來(lái)越被臨床研究所支持,尤其對于一些不具有典型臨床癥狀,診斷困難的腫瘤有著(zhù)明顯優(yōu)勢。另外,在個(gè)性化健康管理方面,人們可以根據自己的病史,家族史,生活工作習慣,居住地等情況在臨床醫生協(xié)助下制定腫瘤早篩體檢方案。

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